Auteur / Autrice : | Bastien Ducreux | |
Direction : | Patricia Fauque | |
Type : | Projet de thèse | |
Discipline(s) : | Médecine, biochimie, biologie cellulaire et moléculaire, physiologie et nutrition | |
Date : | Inscription en doctorat le | Soutenance le 27/02/2024 |
Etablissement(s) : | Bourgogne Franche-Comté | |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Environnements, Santé | |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Center of translational and molecular medicine | |
Jury : | Président / Présidente : Hélène Jammes | |
Examinateurs / Examinatrices : Patricia Fauque, Véronique Duranthon, Daniel Vaiman, Deborah Bourc'his, Catherine Patrat | ||
Rapporteurs / Rapporteuses : Véronique Duranthon, Daniel Vaiman |
Mots clés
Résumé
Des millions d'enfants sont nés à travers le monde grâce aux techniques d'assistance médicale à la procréation (AMP) dont l'innocuité n'a pas été totalement démontrée à ce jour. Ces techniques concomitantes à la reprogrammation épigénétique pourraient être en lien avec certaines des complications observées après AMP telles les pathologies liées à l'empreinte. Les expérimentions animales ont démontré que ces méthodes pouvaient avoir un impact sur la régulation épigénétique de gènes majeurs pour le développement du conceptus mais chez l'homme cela reste largement inconnu. Nous nous proposons d'étudier les interactions entre les gamètes et lembryon avec le milieu in vitro (vitrification des ovocytes, composition du milieu de culture embryonnaire) chez lhumain par une approche transcriptomique (single-oocyte et single-embryo RNA-seq). Par ailleurs, une analyse critique de la littérature sur les altérations transcriptomiques des ovocytes induites par lAMP a permis didentifier des mécanismes biologiques communs par lesquels différentes techniques dAMP modifient le transcriptome ovocytaire et sa régulation épigénétique. Ensuite, nous aborderons les conséquences à court et à long terme des techniques dAMP sur lensemble du profil épigénétique chez lhumain sur trois périodes clés du développement, à savoir en phase pré-implantatoire, immédiatement à la naissance puis durant lenfance. A cette fin nous avons réalisé une revue systématique et méta-analyse ayant comme thématique le suivi des profils de la méthylation de lADN chez les enfants conçus par AMP. Pour compléter ces données, nous avons mesuré les profils de méthylation chez une cohorte denfants de 7-8 ans conçus par FIV/ICSI à laide de puces EPIC (Illumina). De façon générale, la majorité des interventions en AMP sont susceptibles de dinterférer sur la reprogrammation épigénétique des gamètes et embryons. Les faibles taux de réussite en AMP et surtout leur variabilité inter-clinique pourraient être un témoin quaujourdhui, les modifications épigénétiques (dans les lignées germinales ou chez lembryon) et leurs conséquences sur léchec dune tentative dAMP ne sont pas assez prises en compte dans les pratiques actuelles. Dans le prolongement de cette thèse, des protocoles dAMP plus sûrs sont nécessaires et la recherche doit aller en ce sens.