Thèse en cours

Une mutation ponctuelle, Y685F dans le cytoplasmique domaine de la VE-cadhérine affecte la transcriptomique endothéliale : des études fondamentales aux applications cliniques
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Triangle exclamation pleinLa soutenance a eu lieu le 29/11/2023. Le document qui a justifié du diplôme est en cours de traitement par l'établissement de soutenance.
Auteur / Autrice : Olivia Garnier
Direction : Isabelle Vilgrain
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Biologie cellulaire
Date : Inscription en doctorat le
Soutenance le 29/11/2023
Etablissement(s) : Université Grenoble Alpes
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale chimie et science du vivant
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : BGE - Laboratoire Biosciences et bioingénierie pour la Santé
Jury : Président / Présidente : Christophe Ribuot
Examinateurs / Examinatrices : Isabelle Vilgrain, Gilles Pages, Barbara Garmy-susini, Donald Martin, Olivia Lenoir
Rapporteurs / Rapporteuses : Gilles Pages, Olivia Lenoir

Résumé

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Les vaisseaux sanguins anormaux dans les tumeurs et les jonctions anormales entre cellules endothéliales restent encore mal compris. Dans le cas du glioblastome, une tumeur hautement vascularisé, la VE-cadhérine est retrouvé comme une cible pour la phosphorylation par Src. Nous avons précédemment publié la génération d'une souris porteuse de la mutation sur la tyrosine 685 remplacée la phénylalanine (Y685F) dans la partie cytoplasmique de la VE-cadhérine. Cette mutation empêche toute phosphorylation sur ce site. Etant donné que la VE-cadhérine est exclusivement exprimée dans les cellules endothéliales (CE), il est raisonnable d'émettre l'hypothèse que cette mutation dans la protéine pourrait avoir un effet sur la liaison des protéines partenaires de la VE-cadhérine comme Beta-caténine et ainsi conduire à la modulation de l'expression des gènes endothéliaux. L'utilisation de la souris Y685F de la VE-cadhérine nous permettra d'approfondir nos connaissances sur le rôle exact de cette tyrosine dans la régulation des gènes et des voies de signalisation des cellules endothéliales. Le RNA-seq nous montre une dérégulation de plus de 800 gènes. Se focalisant sur les gènes liés à l'angiogenèse, nous avons choisi S1pr1, retrouvé sur-exprimer chez les KI. En terme de mécanisme, le chromatin immunoprecipitation assay (ChIP) a démontré que FOXF1, le facteur de transcription de S1pr1 se liait 7 fois plus au promoteur de S1pr1 chez les cellules endothéliales KI que chez les WT. Ainsi, il induisait la surexpression de S1pr1 chez les cellules endothéliales KI qui en retour stabilise la VE-cadhérine à la membrane. Un point important de l'étude est que nous avons trouvé que le mutant était plus phosphorylé sur Y731 de la VE-cadhérine par Src. VE-cadhérine se retrouvait plus associé à Src chez les KI mais moins avec Beta-caténine dont ce dernier était délocalisé dans le noyau. L'analyse morphométrique des coupes de poumons de souris ont montré moins de vaisseaux ainsi qu'un remodelage vasculaire avec moins de dépôt de collagène autour des vaisseaux. Ainsi ces données in vitro et in vivo démontre que la mutation sur la VE-cadhérine sur Y685 active S1pr1 via FOXF1 pour stabiliser les vaisseaux du poumon adulte. Par conséquent, nos recherches fournissent un nouveau point de vue sur le rôle de Y685 de la VE-cadhérine qui participe à la reprogrammation des gènes de la cellule endothéliale qui sont cruciales pour le développement des vaisseaux tumoraux et l'identification de cibles thérapeutiques. De plus, nous avons étudié la modification de la VE-cadhérine par le microenvironnement tumoral en établissant des modèles 2D et 3D avec des cellules du cancer triple négatif et des cellules endothéliales. Cette étape est cruciale pour développer de nouveaux outils cliniques afin d'étudier la modification d'une protéine et l'efficacité d'un médicament. Et enfin, nous avons étudié la VE-cadhérine comme un potentiel biomarqueur chez le patients atteints du COVID associé à des symptômes de détresse respiratoire.