Thèse en cours

Analyse Statistique du Développement Thymique
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Auteur / Autrice : Francesco Camaglia
Direction : Thierry MoraAleksandra Walczak
Type : Projet de thèse
Discipline(s) : Physique
Date : Inscription en doctorat le 01/09/2019
Etablissement(s) : Université Paris sciences et lettres
Ecole(s) doctorale(s) : Physique en Ile de France
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire de physique de l'ENS (Paris ; 2019-....)
établissement opérateur d'inscription : École normale supérieure (Paris ; 1985-....)

Résumé

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Les vertébrés utilisent un répertoire diversifié de récepteurs immunitaires adaptatifs, comme les récepteurs de cellules T (TCR) pour se protéger contre les agents pathogènes et les aberrations internes comme les cellules malignes. Les progrès récents dans le séquençage permettent maintenant le profilage en profondeur des répertoires individuelles. Ce séquençage du répertorie (RepSeq) est très prometteur pour déterminer l'état immunitaire des individus, mesurer leur réponse aux vaccins ou aux immunothérapies, et prévoir leur réaction aux infections. De tout façon, si nous voulons utiliser les répertoires immunitaires comme outil de diagnostic en médecine ou induire des modifications dans les répertoires pour cibler la maladie, nous avons besoin d'une très bonne idée de ce qui constitue le répertoire d'une personne en bonne santé et comment elle se développe. Le but de ce projet de doctorat est de mettre au point des outils d'analyse fondés sur la mécanique statistique pour comprendre comment la sélection positive et négative au cours du développement thymique façonne le répertoire sain des cellules T et a une incidence sur le phénotype et la fonction des cellules T. Nous obtiendrons des Repseq de sous-populations de cellules T bien définies auprès de nos collaborateurs au Weizmann Insitute. Ces séquences seront échantillonnées lors de leur développement dans le thymus. Le projet vise à développer de nouveaux outils d'analyse inspiré par la mécanique statistique de systèmes désordonnés et des expériences sur mesure pour identifier les signatures de sélection (positive et négative) pendant le développement thymique. Cela favorisera notre compréhension de la façon dont la sélection thymique influence le répertoire sain du TCR et stimule l'enquête des liens potentiels entre la sélection thymique et des pathologies telles que l'auto-immunité.