Identification et caractérisation de nouveaux peptides antimicrobiens ciblant le ribosome bactérien

par Pauline Cossard

Projet de thèse en Biochimie

Sous la direction de Axel Innis.

Thèses en préparation à Bordeaux , dans le cadre de École doctorale Sciences de la vie et de la santé , en partenariat avec Mergny (laboratoire) et de MicroR³ - Microbial RNAs, Ribosomes and Regulation (equipe de recherche) depuis le 09-09-2019 .


  • Résumé

    Les peptides antimicrobiens agissant sur le ribosome sont des composés très prometteurs dans la lutte contre les bactéries résistantes aux antibiotiques(Charon et al., 2018). L'équipe Innis, en collaboration avec le groupe de J.-C. Baret (CRPP, Bordeaux) développe une approche d'évolution dirigée basée sur la microfluidique pour identifier des peptides quiinhibent la traduction bactérienne en ciblant le ribosome. Le doctorant ou la doctorante identifiera de nouveaux peptides inhibiteurs, déterminera leur mécanisme d'action en utilisant diverses approches biochimiques et structurales (cryo-microscopie électronique et ou cristallographie aux rayons X), et identifiera des variantes capables de pénétrer et de neutraliser les bactéries à Gram négatif. Ce projet interdisciplinaire montrera comment de nouveaux peptides inhibiteurs de la traduction bloquent le ribosome et aidera à développer des composés capables de combattre les souches bactériennes résistantes.

  • Titre traduit

    Identification and characterization of novelribosome-targeting antimicrobial peptides


  • Résumé

    Ribosome-targeting antimicrobial peptides show great promise as a means to tackle drug resistant bacteria (Charon et al., 2018).The Innis laboratory, in collaboration with J.-C.Baret's group (CRPP, Bordeaux), is developing a microfluidics-based directed evolutionapproachto identify peptides that blockbacterial translation by targeting theribosome.The doctoral candidate will perform the microfluidics-based identification of novel inhibitory peptides, determine their mechanismof action using a combination of biochemical and structural (cryo-EM and/or X-ray) approaches, and identify variants with the ability to penetrate and neutralize Gram-negative bacteria. This interdisciplinary project will reveal how novel peptide-based inhibitors of translation blockthe ribosome and will help develop compounds to overcome resistant bacterial strains.