Un système minimal pour quantifier l'effet du contexte génétique sur l'expression des gènes.

A minimal system to quantify the impact of the genetic context on gene expression

• Auteur / Autrice : Ihab Boulas
• Direction : Sylvie Rimsky, Olivier Rivoire
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génétique
• Date : Soutenance le 13/12/2021
• Etablissement(s) : Université Paris sciences et lettres
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Bio Sorbonne Paris Cité (Paris ; 2014-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie (Paris ; 2011-....)
• Partenaire(s) de recherche : établissement de préparation de la thèse : Collège de France (1530-....)
• Jury : Président / Présidente : Vincent Croquette
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Sylvie Rimsky, Olivier Rivoire, Vincent Croquette, Calin C. Guet, Bianca Sclavi, Sam Meyer
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Calin C. Guet, Bianca Sclavi

Mots clés

Mots clés contrôlés

Génétique

Mots clés libres

Expression Génétique

Régulation génétique

Contexte génétique

Surenroulement de l'ADN

Topoisomerase

Biologie synthétique

Gene expression

Gene regulation

Genetic context

DNA Supercoiling

Topoisomerase

Synthetic biology

Résumé

Les organismes vivants sont porteurs d'ADN. Des segments d’ADN, que l’on appelle gènes, sont responsables de différents procédés cellulaires. Les organismes vivants s’adaptent aux fluctuations de leur environnement par l’activation et la désactivation de certains de leurs gènes. Ce procédé de décision au niveau cellulaire implique de nombreux facteurs. La manière dont les gènes sont organisés sur l’ADN constitue l’un de ces facteurs. Comment l’organisation des gènes contribue-t-elle leur activation et désactivation ? Notre travail consiste en la construction de nouveau systèmes génétiques qui sont conçus pour la mesure quantitative de la manière dont l’organisation affecte leur comportement.

Living organisms carry DNA. Segments of DNA, that we call genes, are responsible for different cellular processes. Living organisms adapt to fluctuating environments by activating and deactivating some of their genes. This decision making at the cellular level involves many factors. The manner in which genes are organised on DNA constitutes an important one. How does the organisation of genes contribute to their being activation and deactivation? Our work consists in building new genetic systems that are designed to quantitatively assess how their organisation affects their behaviour.