Profils épigénétiques des enfants conçus par Assistance Médicale à la Procréation : Influence de la composition des milieux de culture sur les profils de méthylation de l’ADN

Epigenetic profiles of children conceived through Assisted Reproductive Technologies: Influence of in vitro embryo culture on DNA methylation profiles

• Auteur / Autrice : Julie Barberet
• Direction : Patricia Galasso-Fauque
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Médecine, biochimie, biologie cellulaire et moléculaire, physiologie et nutrition
• Date : Inscription en doctorat le 30/10/2017
• Etablissement(s) : Bourgogne Franche-Comté
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Environnements, Santé (Dijon ; Besançon ; 2012-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Lipides, Nutrition, Cancer (LNC) (Dijon)

Mots clés

Mots clés libres

Épigénétique

Assistance médicale à la Procréation

Milieu de culture

Méthylation de l'ADN

Enfant

Epigenetic

Assisted Reproductive Technology

Culture medium

DNA methylation

Children

Résumé

En Assistance Médicale à la Procréation (AMP), les conditions de culture embryonnaire jouent un rôle essentiel, non seulement sur le développement précoce et l’implantation des embryons, mais potentiellement sur la santé à court, moyen et long terme des enfants qui naitront par ces techniques. Nous nous proposons de déterminer l’impact épigénétique du milieu de culture chez les enfants et comprendre les mécanismes impliqués dans les potentielles anomalies du développement. La méthylation de l’ADN, marque épigénétique majeure subissant de grands remaniements lors de la période précoce du développement des embryons, sera étudiée à l’échelle globale mais aussi de manière ciblée au niveau de gènes candidats. Ces analyses seront réalisées à partir de prélèvements salivaires chez des enfants issus de deux milieux de culture, ainsi qu'un groupe contrôle d'enfants du même âge. Nous souhaitons mener en aveugle des analyses de la méthylation de l’ADN à l’échelle globale du génome par une approche à haut débit, « puce à ADN », tandis que des analyses ciblées de profils de méthylation analysés par pyroséquençage à partir d’ADN génomique bisulfité sera réalisée sur les gènes soumis à empreinte et éléments répétés. Nous pensons que les connaissances qui seront apportées par ce projet seront majeures pour l’AMP potentiellement mise en cause dans la survenue de certaines pathologies. Les résultats seront aussi cruciaux pour l’activité au quotidien au laboratoire, ainsi que pour la mise en place d’un suivi à long-terme de la santé des enfants issus d’AMP.

In Assisted Reproductive Technologies (ART), the embryo culture environment plays an essential role on early embryo development and implantation. Potentially, the health of children thus conceived could be impacted. Our purpose is to determine the epigenetic outcome in ART-children according to the in vitro culture medium in which they are conceived, and understand the mechanisms implicated in the potential developmental defects. The DNA methylation which is the major epigenetic mark extensively reprogramed during the early phase of embryos development will be studied at a wider scale and by focusing on specific genes. To this end, buccal smears from a cohort of 5-year-old children will be studied in blinded manner. Epigenetic regulation of imprinted genes, repeat elements and at a wider scale will be studied by using DNA methylation arrays and pyrosequencing. We hope that the knowledge gained from this work will have profound implications for the field of ART, whose safety has been questioned. This project may reveal the involvement of key developmental genes on ART-associated diseases or alternatively, may exclude them.