Métamorphoses diagrammatiques et rythmes expérientiels : la pratique visuelle des scientifiques dans l'analyse de données en virologie

Diagrammatic transformation and lived rythms : scientists visual practice in virology data analysis

• Auteur / Autrice : Estelle Chaillat
• Direction : Annie Gentès, Uriel Hazan, Anne Lefebvre
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Design
• Date : Soutenance le 27/02/2024
• Etablissement(s) : université Paris-Saclay
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences sociales et humanités (Versailles ; 2020-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre de recherche en design (Gif-sur-Yvette, Essonne ; 2019-...)
• Partenaire(s) de recherche : Référent : École normale supérieure Paris-Saclay (Gif-sur-Yvette, Essonne ; 1912-....)
• Partenaire(s) de recherche : graduate school : Université Paris-Saclay. Graduate School Humanités-Sciences du patrimoine (2020-….)
• Jury : Président / Présidente : Michela Deni
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Catherine Allamel-Raffin, Fabienne Martin-Juchat, Béatrice Cahour
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Catherine Allamel-Raffin, Fabienne Martin-Juchat

Mots clés

Mots clés contrôlés

Données de la recherche

Arts graphiques

Information scientifique

Communication visuelle en sciences

Illustration scientifique

Méthodes graphiques

Mots clés libres

Pratiques visuelles

Mediation

Images scientifiques

Diagrammes

Activité

Analyse

Visual practices

Mediation

Scientific images

Diagrams

Activity

Analysis

Résumé

Cette thèse propose de considérer que la transformation des données scientifiques en informations pertinentes pour la recherche, en tant qu'elle est réalisée au travers de la manipulation de formats visuels, est un phénomène pratique de médiation. Ce phénomène articule des dimensions temporelles, affectives et perceptuelles avec des opérations matérielles et des propriétés sémiotiques. Dans ce cadre, il s'agit de décrire et de qualifier la relation phénoménologique tissée entre les formats visuels, le scientifique qui les manipule et les données qu'ils imagent d'un point de vue matériel et expérientiel. Cette recherche prend place dans le domaine de la microbiologie et doit nous permettre de mieux comprendre comment les formats visuels soutiennent le travail d'exploration sémantique des données par les scientifiques.Pour ce faire, la recherche entreprise mobilise une approche ethnographique afin d'observer in situ les pratiques des scientifiques au travail d'analyse de leurs données expérimentales et d'en décrire le déroulé. Elle se concentre sur les activités d'analyse individuelle sur ordinateur. Pour rendre compte finement des pratiques visuelles des scientifiques comme expérience sensible, temporelle, interactive et matérielle, nous avons mis en place une méthode de récolte et d'analyse des données du terrain en « articulation fine » qui permet d'en intégrer le caractère à la fois diachronique et synchronique. Afin d'explorer nos trois études de cas, nous mettons en dialogue trois types de matériaux récoltés sur le terrain. L'enjeu est de pouvoir analyser dialogiquement le « vécu expérientiel » des acteurs, la dimension procédurale de l'activité (tâche, opérations, actions) et les manipulations matérielles des formats visuels au cours (diachronique) de l'activité. Pour ce faire, une analyse thématique de transcriptions d'entretiens d'explicitation est croisée à une analyse procédurale de l'activité réalisée par transcription pictographique des actions et de leurs effets visuels.Il s'agit alors de mener une réflexion sur la relation phénoménologique entre formats visuels et scientifiques au travail. D'une part, cette relation apparait relever d'une « économie de l'attention » qui permet à l'activité de se poursuivre grâce à la dynamisation du processus d'analyse, lui-même rythmé par une alternance de phases « machinales » et « réflexives » qui se rapportent à des postures adoptées par le scientifique. En nous appuyant sur les travaux de Donald Schön, nous montrons que cette alternance permet au scientifique de gérer la complexité de son activité pratique : elle est soutenue par la réactivité des formats visuels avec lesquels le scientifique « converse » et qui actualisent chez lui une capacité de projection pratique et émotionnelle. Cette dynamique conversationnelle met en avant l'importance de la manipulabilité des formats visuels pour l'analyse et leur valeur de médium : les images permettent d'explorer les objets d'étude par des expérimentations sémiotiques. Nous indiquons que cette manipulabilité repose sur le régime « diagrammatique » des formats visuels mobilisés en analyse. Les visuels indexent certaines relations structurelles des objets qu'ils aident à renseigner à leurs éléments morphologiques, constitué en système notationnel modulable. Nous montrons que dans l'activité, des « coupures sémiotiques » peuvent se produire : elles dévoilent que le scientifique travaille activement à maintenir la « diagrammaticité » des images scientifiques afin d'assurer à leurs images et leur analyse une « valeur scientifique ». Cet entretien se réalise par des explorations diverses menant à des compromis sur la base de tâtonnements : le phénomène de médiation apparait alors comme le fruit d'une expérience progressive au long de l'activité qui souligne sa dimension émergente, matérielle et expérientielle.

This thesis considers that the transformation of scientific data into information, through the manipulation of visual displays, is a practical phenomenon of mediation. It articulates temporal, affective, and perceptual dimensions. We propose to analyze this phenomenon from a material and experiential point of view: we aim at describing and qualifying the relationships between visual displays, the datas imaged and the lived experience of the scientist who manipulates them. This research, which takes place in the field of microbiology, aim to better understand how visual displays support semantic exploration of experimental datas by scientists.To do so, we articulate an ethnographic approach to observe the practices of scientists and describe their individual analysis activities on computer. Our first contribution is empirical. To account for the unfolding visual practices of scientists as a temporal, interactive and material experience, we propose a method that allows to integrate both its diachronic and synchronic character. The second contribution of this thesis is methodological : our corpus is made up of three case studies and articulate three types of materials collected from our fieldwork (video and audio recording of the activity, recording of computer screen, and elicitation interviews). This method aim at articulating and analyze together the ”lived experience” of the scientists, the procedural dimension of the activity (tasks, operations, actions), and the morphological evolution of the visual formats over the course of the activity. We analyze our datas by bridging a thematic analysis of our elicitation interviews with a procedural analysis transcribed through a pictographic transcription method which reflects both the actions carried out during the activity and their effects on the visuals's morphology.In terms of theoretical contributions, we articulate a reflexion about the phenomenological relationship between visual displays and scientists as it allows mediation to takes place. Our analysis shows that this relationship organize an “economy of attention” that sustain the ongoing activity by means of a dynamisation of it's temporal unfolding, rythmed by an alternation of “machinic” and “reflexive” phases. Elaborating on Donald Schön's epistemology of practice, we show that this alternation allows the scientist to manage the complexity of their practical activity through a “conversational” collaboration with visual displays. We characterize this dynamisation of the analyzing process as a result of the reactive nature of visual displays that operate a capacity for practical and emotionnal projection on the scientist part. This collaboration point the importance of the manipulability of visual displays and characterize them as medium through which scientists can elaborate semiotic experimentations. We show that this manipulability is conditionned by visual displays's diagrammatic nature. Visual displays index proprieties of the scientist's object of interest to their morphological elements which in turn are malleable in practice. We identify “semiotic breach” during practice that disclose the active participation of the scientist to sustain this diagrammatic operativity in order to ensure a “scientific value” for their analysis and their images. This active participation involve multiple semiotic explorations that progressively allows scientists to reach compromises. The practical phenomenon of mediation appears as progressive and dynamic processus, highlighting it's emergent, material and experiential nature.