Analyse de la diversité génétique des espèces de Babesia infectant les rongeurs en Asie du Sud-Est

Genetic diversity of Babesia species isolated from rodent hosts in South-East Asia

• Auteur / Autrice : Anamika Karnchanabanthoeng
• Direction : Bernard Carcy, Serge Morand
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biologie Santé
• Date : Inscription en doctorat le 03/11/2014
• Etablissement(s) : Montpellier
• Ecole(s) doctorale(s) : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé (Montpellier ; Ecole Doctorale ; 2015-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : VAP - Vaccination AntiParasitaire

Mots clés

Mots clés libres

Babesia

Diversité génétique

Hôtes rongeurs

Asie du Sud-Est

Babésiose humaine

Babesia

Genetic diversity

Rodent hosts

South-East Asia

Human babesiosis

Résumé

Émergences et réémergences des maladies infectieuses font peser des menaces graves pour la santé humaine et animale. On peut citer les maladies tropicales négligées dues aux protistes parasites d'importance médicale et vétérinaire. La babésiose, provoquée par une variété de protozoaire intra-érythrocytaire connue sous le nom de groupe Babesia et leurs espèces apparentées, Theileria et Cytauxzoon, est l'une d'entre elles. Cette maladie transmissible à tique est présente dans le monde entier avec l’agent Babesia comme le deuxième hémoparasite le plus courant chez les mammifères. Cependant, on note de plus en plus de cas humains dans le monde, ce qui suggère une capacité d'adaptation de certaines espèces de Babesia à l'hôte humain. Les causes restent encore incertaines, mais la répartition géographique des tiques, et par conséquent les espèces réservoirs de Babesia, font suspecter l’importance des rongeurs réservoirs. Le but de ce projet de thèse est d'analyser les relations entre les espèces de rongeurs et les espèces de Babesia en Asie du Sud-Est, qui est un « point chaud » à la fois pour la biodiversité et pour les maladies infectieuses émergentes. Les analyses des données moléculaires de plus de 1000 échantillons de sang prélevés sur des rongeurs dans des localités géographiques distinctes de l'Asie du Sud-Est permettront de caractériser la diversité génétique des espèces et des souches de Babesia et seront comparées phylogénétique aux données existantes. Cette surveillance de la diversité des agents pathogènes complétera les informations épidémiologiques et de fournira un système d'alerte précoce pour l'émergence de la babésiose par l’utilisation d’outils de diagnostic efficace, de médicaments et de vaccins ciblés.

Worldwide outbreaks of emerging and re-emerging infectious diseases pose serious threats to human and animal health. Among these infectious diseases are neglected tropical diseases due to parasitic protists of medical and veterinary importance. Babesiosis, caused by a variety of intraerythrocytic protozoan known as the group of Babesia and their relative species, Theileria and Cytauxzoon, is one of them. This worldwide spread tick transmitted disease is considered of veterinary importance and Babesia is concerned to be the second most common hemoparasite in the blood of mammals. However, the increasing reports of human cases around the world strongly suggest an adaptive ability of some Babesia species to human host. The reason why remains unclear but geographical distribution (and consequently the Babesia species they might carry) of ticks and wildlife, especially rodents which are reservoirs of most of human Babesia species, might be suspected. The purpose of this research project is to analyze potential relationships between rodent species and Babesia species in South-East Asia, which is a hotspot both for biodiversity and infectious diseases. Molecular and bioinformatics data, derived from the analysis of more than 1000 blood samples collected on rodents from distinct geographical areas of South-East Asia, will be used to determine the genetic diversity of Babesia species and strains from rodent hosts in South-East Asia and for comparative phylogenetic analysis with already available data. This pathogen diversity surveillance will provide and help to complete epidemiological information and provide an early warning system for the emergence of babesiosis therefore high-throughput diagnostic tools and well-targeted drugs and vaccines.