Optimisation et développement de milieux de culture

Optimization and development of culture media

• Auteur / Autrice : Marion Bonnet
• Direction : Didier Raoult
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Maladies infectieuses
• Date : Soutenance le 22/11/2019
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Mephi (Marseille) - Méditerranée Infection
• Jury : Président / Présidente : Florence Fenollar
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Florence Fenollar, Ziad Daoud, Max Maurin
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Ziad Daoud, Max Maurin

Mots clés

Mots clés contrôlés

Déshydratation

Bactéries anaérobies

Enterococcus hirae

Milieux de culture

Mots clés libres

Milieu de culture

Enterococcus hirae

Bactéries anaérobies

Déshydratation

Culture medium

Enterococcus hirae

Anaerobic bacteria

Dehydration

Résumé

Du fait de la découverte de nouvelles espèces bactériennes grâce à la technique de culturomics consistant à utiliser un grand nombre de milieux de culture et de conditions de culture, la culture bactérienne a connu un nouvel essor. Il est nécessaire de développer des milieux de culture sélectifs afin d’isoler des bactéries spécifiques. En effet, certaines bactéries ont une grande importance en santé humaine et notamment dans l’induction de la réponse à certains traitements anti-cancéreux. Identifier rapidement ces bactéries dans le microbiote intestinal des malades pourra permettre un gain de temps dans la prise en charge de leur maladie. De plus, arriver à cultiver dans un même milieu les bactéries anaérobies et aérobies en conditions d’aérobiose permettrait également une plus grande rapidité dans le rendu des résultats et le traitement des patients en cas d’infection. Ce travail de thèse a été divisé en quatre objectifs : établir les éléments essentiels à l’élaboration d’un milieu de culture et à la croissance des bactéries, mettre au point un milieu de culture qui permette l’isolement de la bactérie Enterococcus hirae, optimiser un milieu de culture qui permette à la fois la croissance des bactéries anaérobies et aérobies en conditions d’aérobiose, développer une technique qui permette d’hydrater en continu la gélose.

Due to the discovery of new bacterial species through the culturomics technique of using a large number of culture media and culture conditions, bacterial culture has experienced a new boom. It is necessary to develop selective culture media in order to isolate specific bacteria. Indeed, certain bacteria have a great importance in human health and in particular in the induction of the response to certain anti-cancer treatments. Quickly identifying these bacteria in the patients' intestinal microbiota can save time in the management of their disease. In addition, the ability to culture anaerobic and aerobic bacteria in the same medium under aerobic conditions would also allow for faster results and treatment of patients in the event of infection. This thesis work has been divided into four objectives: establish the essential elements for the development of a culture medium and the growth of bacteria, develop a culture medium that allows the isolation of Enterococcus hirae bacteria, optimize a culture medium that allows both anaerobic and aerobic bacteria to grow under aerobic conditions, and develop a technique that allows agar to be continuously hydrated.