Étude de l’interaction physique et fonctionnelle entre le complexe histone méthyltransférase SET-2/SET1 et le complexe histone déacétylase SIN-3S dans l’embryon de C. elegans
Auteur / Autrice : | Flore Beurton |
Direction : | Francesca Palladino |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biologie |
Date : | Soutenance le 29/06/2018 |
Etablissement(s) : | Lyon |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale de Biologie Moléculaire Intégrative et Cellulaire (Lyon) |
Partenaire(s) de recherche : | établissement opérateur d'inscription : École normale supérieure de Lyon (2010-...) |
Laboratoire : Laboratoire de biologie et modélisation de la cellule. Lyon (1987-….) | |
Jury : | Président / Présidente : Marie Delattre |
Examinateurs / Examinatrices : Francesca Palladino, Marie Delattre, Peter Meister, Slimane Ait-Si-Ali, Jérôme Govin | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Peter Meister, Slimane Ait-Si-Ali |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Mots clés libres
Résumé
Les complexes histones méthyltransférases SET1, hautement conservés de la levure aux mammifères, sont ciblés aux régions promotrices par la protéine CFP1/CXXC, résultant en l’implémentation de la méthylation de la lysine 4 de l’histone H3 (H3K4me), modification post-traductionnelle influençant l’expression des gènes selon le contexte chromatinien. La présence de plusieurs complexes SET1 distincts dans différents systèmes modèles eucaryotes a compliqué l’étude de leurs fonctions dans un contexte développemental. Caenorhabditis elegans contient une seule protéine homologue de SET1, SET-2, et d’uniques homologues des autres sous-unités du complexe, RBBP5, ASH2, WDR5, DPY30 et CFP1. Cependant, la composition biochimique du complexe n’a pas été décrite. En couplant des expériences de co-immunoprécipitation avec des analyses de spectrométrie de masse, j’ai identifié le complexe SET-2/SET1 dans les embryons de C. elegans. D’autre part, j’ai montré que le complexe SET-2/SET1 co-immunoprécipite aussi un autre complexe conservé modifiant la chromatine et j’ai mis en évidence les interactions mises en jeu entre ces deux complexes. Mon analyse génétique a démontré que les mutants de perte de fonction des sous-unités des deux complexes partagent des phénotypes communs, en cohérence avec des fonctions développementales communes. Le laboratoire a également entrepris des expériences de transcriptomique et d’immunoprécipitation de la chromatine montrant un nouveau rôle de CFP-1 dans le recrutement de ce complexe au niveau de sites spécifiques de la chromatine.