Etude fonctionnelle des enhancers lymphoides
Auteur / Autrice : | Jaafar Ghadeer Khudhair Al-Omairi |
Direction : | Salvatore Spicuglia |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Génétique |
Date : | Soutenance le 11/12/2017 |
Etablissement(s) : | Aix-Marseille |
Ecole(s) doctorale(s) : | École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : TAGC. Technological advances for genomics and clinics (marseille) |
Jury : | Président / Présidente : Jean-Christophe Andrau |
Examinateurs / Examinatrices : Pascal Rihet, Véronique Adoue, Catherine Nguyen | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Thomas Sexton |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Mots clés libres
Résumé
Les amplificateurs (aussi appelés par le terme anglais enhancers) ont été initialement identifiés comme des séquences d'ADN agissant en cis qui augmentent la transcription d'une manière qui est indépendante de leur orientation et de leur distance par rapport au site d’initiation de la transcription. En outre, les gènes d'identité cellulaire sont souvent associés à des regroupements ou clusters d’enhancers, structures également appelées super-enhancers, censés assurer une régulation correcte de l'expression des gènes tout au long du développement et de la différenciation des cellules. Pour mieux comprendre la régulation des gènes à partir de ces réseaux régulateurs complexes, nous avons étudié la régulation du gène Ikzf1 qui code pour un facteur de transcription essentiel à la différenciation lymphoïde et également impliqué dans la leucémogenèse. En combinant différents types de données épigénomiques, nous avons privilégié l’étude d’un élément enhancer situé à 120 kb en amont du gène Ikzf1. Nous avons trouvé que la délétion de l'enhancer IkE120 entraine une réduction significative de l'ARNm d’Ikzf1. Cependant, nous avons observé que la transcription immature ainsi que l’usage des promoteurs et exons alternatifs d’Ikzf1 sont différemment affectée dans les cellules délitées par IKE120. Ces résultats semblent indiquer que l'élément IkE120 pourrait avoir des fonctions supplémentaires au-delà de la seule régulation de l'initiation de la transcription.