Régulation et rôle d'ADAR1 dans l'hyper-édition phase-dépendante des transcrits ERL du GaHV-2 : un ARNInc antisens des pri-miARN des régions Rl

Regulation and role of ADAR1 in the phase-dependent hyperediting of the GAHV-2 ERL transcript : a new antisens LNCRNA of the pri-mirnas from the RL region

• Auteur / Autrice : Thomas Figueroa
• Direction : Denis Rasschaert
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la vie, spécialité Virologie
• Date : Soutenance le 13/12/2016
• Etablissement(s) : Tours
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire ; 2012-....)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte (Tours)
• Jury : Président / Présidente : Alain Legrand
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Sonia Lacroix-Lamandé
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Stéphane Bertagnoli, Tristan Renault

Mots clés

Mots clés contrôlés

MicroARN

ARN -- Modifications posttranscriptionnelles

Promoteurs (génétique)

Transcription génétique

Régulation génétique

ARN -- Édition

Maladie de Marek

Virus de la maladie de Marek

Mots clés libres

Herpèsvirus

GaHV-2

ARNlnc

''miARN''

Édition

Promoteur

ADAR1

SOCS1

Herpesvirus

GaHV-2

''lncRNA''

''miRNA''

Editing

Splicing

ADAR1

SOCS1

Résumé

Le virus de la maladie de Marek (GaHV-2), est un ''-herpèsvirus induisant des lymphomes T chez le poulet. L’étude des pri-miARN des régions RL à partir des miR-M4, -M11, M31 et -M1 a montré des initiations de transcription dispersées et internes aux longs pri-miARN initialement décrits. Les tests de fonctionnalité des régions en amont ont permis de conclure quant à l’absence d’activité promotrice suggérant une régulation par le prmiR-M9M4, caractérisé dans cette étude, ou par le prMeq. Le gène de 7,5 kpb d’un ARNlnc (ERL, Edited Repeat Long) épissé et antisens à ces transcrits a été caractérisé. Une hyper-édition A-en-G des transcrits ERL par ADAR1 a été mis en évidence. Principalement lié au cycle lytique, l’édition indique une répression fonctionnelle durant cette phase. Les régulations de l’expression d’ADAR1 chez l’humain, positives par la voie de réponse aux interférons et négatives par SOCS1, ont été validées chez le poulet. L’inhibition de SOCS1 par le gga-miR-155 et son orthologue viral mdv1-miR-M4-5p a été montré fonctionnelle chez le poulet comme chez l’humain et mène à une surexpression d’ADAR1 lors de l’activation des voies de réponse aux interférons.

Marek’s disease virus (GaHV-2) is an ''-herpesvirus that induces T-cell lymphoma in chickens. In this study, we have shown that some pri-miRNAs, which are specific of miR-M4, -M11, M31 et -M1, initiated at dispersed transcription start sites. They are located in internal positions from previously described pri-miRNAs but upstream sequences lack promoter activity, indicated a potential regulation by the upstream prmiR-M9M4, characterised during this study, or the prMeq. The 7.5 kbp gene of the ERL (Edited Repeat Long) lncRNA, which is alternatively spliced et antisense of these pri-miRNAs was defined. An extensive A-to-G hyperediting of it sequence was observed strongly linked to the lytic phase, indicated a functional repression during this phase. We showed that, like the human one, the chicken ADAR1 expression was positively controlled by the IFN response pathway et negatively by the suppressor of cytokine signaling 1 (SOCS1). Like the human et murine miR-155-5p, the chicken gga-miR-155-5p et the GaHV-2 analog mdv1-miR-M4-5p deregulate this pathway by targeting et repressing expression of SOCS1, leading to the upregulation of ADAR1.