Relations entre l'organisation du génome et l'expression des gènes chez les mammifères

• Auteur / Autrice : Marie Sémon
• Direction : Laurent Duret
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Lyon 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Mammifères

Phénotype

Expression génique

Génome

Résumé

La composition en bases, la densité en gènes et en éléments transposables sont variables dans les génomes de mamifère. Ces "paysages génomiques" ont-ils une conséquence sur le phénotype ? Pour répondre à cette question, j'ai étudié les facteurs qui influencent l'organisation des séquences transcrites dans le génome humain. J'ai montré d'une part que la composition en bases et en éléments transposables des gènes est liée à leur expression. D'autre part, les gènes ne sont pas positionnés au hasard dans le génome : les gènes co-exprimés sont regroupés en clusters. J'ai montré que certains regroupements sont fonctionnels. D'autres sont provoqués par l'interférence de l'expression entre des gènes voisins. De nombreux mécanismes, à la fois neutres et sélectifs contribuent à l'organisation des gènes sur les chromosomes