Repression de la transcription du retroposon s1 par la methylation chez brassica napus : mecanismes et impacts

• Auteur / Autrice : Philippe Arnaud
• Direction : Jean-Marc Deragon
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques fondamentales et appliquées
• Date : Soutenance en 2000
• Etablissement(s) : Clermont-Ferrand 2

Résumé

Les retroposons sine sont une classe d'elements transposables decrite dans une variete de genomes eucaryotes. Malgre la presence d'un promoteur interne potentiellement actif, la transcription des sine in vivo est generalement faible et limitee a un petit nombre d'elements. Afin de tester si la methylation de l'adn pouvait etre impliquee dans cette repression, nous avons utilise comme modele l'element sine de plante, s1, present dans le genome de brassica napus (colza). Nous avons observe que in vivo, s1 s'integre preferentiellement dans des regions hypomethylees de l'adn, dans lesquelles il va etre specifiquement cible par des methylases. In vitro, nous montrons que les elements s1 possedent effectivement un promoteur autonome dont l'activite est reprimee par la methylation. Une etude plus precise, menee sur une sequence source putative, le locus na7, illustre egalement l'importance de certaines regions adjacentes pour stimuler la transcription. Nous mettons enfin en evidence une regulation post-transcriptionnelle qui agit en clivant le transcrit s1 dans sa partie 3, produisant un arn s1 sans region polya. Ces resultats indiquent que la methylation fait probablement partie d'un mecanisme de defense de l'hote agissant specifiquement sur l'ensemble des elements s1. Seules certaines sequences possedant des regions externes appropriees pourront passer outre ce mecanisme. De facon plus inattendue, nous avons observe que, in vivo, la methylation peut se propager a partir de certaines sequences s1 vers les regions adjacentes, et ce de facon exclusivement unidirectionnelle. Un modele permettant la propagation unidirectionnelle est presente. L'impact de cette propagation et des modifications epigenetiques distales qu'elle peut engendrer dans les genomes eucaryotes est discute. Enfin, nous avons mis en evidence, tout comme pour les s1, qu'un mecanisme est egalement capable de methyler specifiquement un nombre limite de sequences alu humaines, sur les positions symetriques et asymetriques, et ceci de facon sexe specifique.