Structure et évolution de la famille L1 de longues séquences répétées dispersées du génome de la souris

Structure and evolution of the l1 interspersed repeated family in the mouse genome

• Auteur / Autrice : Véronique Jubier-Maurin
• Direction : Gérard Roizès
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences
• Date : Soutenance en 1989
• Etablissement(s) : Montpellier 2

Mots clés

Mots clés contrôlés

Séquence des acides aminés

ADN

Génome

Lignées cellulaires

Souris

Résumé

Chez la souris, une seule famille de longues sequences repetees a ete bien caracterisee: la famille l1. Les donnees actuelle suggerent que la dispersion des elements l1 ait eu lieu par retrotransposition, a partir des transcrits des copies progenitrices completes. Nous avons compare son organisation dans plusieurs especes apparentees. Deux mecanismes, la conversion et la retrotransposition, pourraient intervenir dans l'evolution concertee des repetitions l1. Des etudes prealables ont montre que plusieurs elements l1 complets possedent en 5 differents motifs repetes en tandem, a ou f. Leur sequence presente des analogies avec les promoteurs des genes housekeeping. Nous avons etudie l'association de ces motifs avec les elements l1. La plupart des copies completes ne possedent pas de telles repetitions en 5. Les motifs de type f ne sont pas toujours associes aux elements complets. Les sequences l1 de type a ont ete introduites plus recemment au cours de l'evolution que celles de type f. En effectuant la sequence de la region 5 de deux copies completes avec des repetitions f, nous avons verifie que celles-ci faisaient partie integrante des sequences l1. Une relation entre les deux types, a et f, de copies fondatrices et des sous-familles bien definies a ete recherchee: d'une part, les deux categories de sequences se distinguent en 5 par un site de restriction; d'autre part, les repetitions de l'orf1 sont organisees differemment dans chacune d'elles. Ces correlations indiquent que des sous-familles particulierement de sequences l1 sont issues de copies progenitrices de chaque type a et f