Adaptation  Antibiorésistance  Bactéries phytopathogènes  Biofilms  Bioinformatique  Biosciences  Drosophiles  Endosymbiose  Escherichia coli  Gammarus  Génome  Génomique  Legionella pneumophila  Marqueurs biologiques  Microbiologie  Modèles mathématiques  Modélisation  Mortalité  Métabolisme  Paléoenvironnement  Phylogénie  Rhizosphère  Régulation  Résistance aux antibiotiques  Staphylococcus aureus  Staphylocoque doré  Symbiose  Transcriptome  Transposons  Virulence  Virulence  Wolbachia  Épidémiologie  Évolution  Évolution  Évolution moléculaire  

3 ongoing theses in this doctoral school
Excerpt from most recent:

Étude par approche génomique de la pathogénicité, de la circulation et de la persistance des souches d'E.coli producteurs de shiga-toxines (STEC) du sérotype O26H11 portant le gène stx2 dans la filière bovine laitière en France.

by Nathan Soleau supervised by Delphine Thévenot-Sergentet - Marcy l’Etoile, VetAgro Sup

Micro-organismes, interactions, infections

Ongoing since 13-12-2022

Climatic, environmental changes and human impacts in Central Africa over the last 10 ka inferred from organic biomarkers

by Valentine Schaaff supervised by Guillemette Menot - Lyon, École normale supérieure

Géologie

Ongoing since 01-10-2020

Characterization of a new virulence factor secreted by the plant pathogenic bacteria Dickeya dadantii

by Lulu Liu supervised by Guy Condemine - Lyon

Microbiologie moléculaire

defended on 05-04-2019

544 defended theses in this doctoral school
Excerpt from most recent:

Isotopes du calcium et paléoanthropologie du Paléolithique moyen

by Pierre-Jean Dodat supervised by Vincent Balter and Bruno Maureille . - Lyon, École normale supérieure

Sciences de l'univers

defended on 23-02-2023

Role of the clathrin adaptor AP-1 in the virulence and the biogenesis process of secretory vesicles in the plant-pathogenic fungus Botrytis cinerea

by Glen Calvar supervised by Yvan Rahbé and Nathalie Poussereau . - Lyon, INSA

Microbiologie

defended on 14-12-2022

Les amibes comme approche thérapeutique pour lutter contre les bactéries multirésistantes aux antibiotiques

by Félix Bornier supervised by Xavier Charpentier and Bénédicte Coupat-Gataland . - Lyon 1

Microbiologie

defended on 09-11-2022

Paroi et camouflage moléculaire chez le champignon phytopathogène Botrytis cinerea

by Mélanie Crumière supervised by Nathalie Poussereau and Mathias Choquer . - Lyon 1

Microbiologie moléculaire

defended on 07-11-2022

Étude de l’adhésion des STEC aux globules gras du lait cru : une clé dans la prévention du danger STEC dans la filière lait cru et fromage au lait cru ?

by Arthur Bagel supervised by Delphine Thévenot-Sergentet - Lyon 1

Biologie

defended on 04-11-2022

Impact de l’histoire évolutive du blé sur les interactions avec les communautés fonctionnelles microbiennes de la rhizosphère

by Cécile Gruet supervised by Yvan Moënne-Loccoz and Daniel Muller . - Lyon 1

Ecologie microbienne

defended on 04-11-2022

Les facteurs de virulence de Staphylococcus aureus associés aux pneumonies communautaires sévères : focus sur l’hémolysine-gamma

by Mariane Pivard supervised by François Vandenesch - Lyon 1

Microbiologie

defended on 25-10-2022

Development of a genetic tool for the creation of mutant collections : application to the study of the fungal cell wall in Botrytis cinerea

by Matthieu Blandenet supervised by Christophe Bruel and Mathias Choquer . - Lyon 1

Microbiologie moléculaire

defended on 14-10-2022

Influences des perturbations environnementales sur l’association wMelPop-D. melanogaster

by Alexis Bénard supervised by Natacha Kremer and Fabrice Vavre . - Lyon 1

Biologie

defended on 29-09-2022

Approche biogéographique et fonctionnelle des communautés de macroinvertébrés benthiques des cours d’eau tropicaux insulaires des Caraïbes

by Chevelie Cineas supervised by Sylvain Doledec and Dieuseul Prédélus . - Lyon 1

Ecologie des cours d’eau tropicaux

defended on 21-09-2022

Mise en place d'une approche de métagénomique pour la surveillance des infections respiratoires virales

by Antonin Bal supervised by Florence Morfin-Sherpa , Karen Brengel-Pesce and Laurence Josset . - Lyon 1

Virologie

defended on 20-09-2022

Origine, évolution et extinction de Sylviornis neocaledoniae, oiseau non-volant de Nouvelle-Calédonie

by Ségolène Riamon supervised by Antoine Louchart and Sébastien Steyer . - Lyon 1

Paléontologie

defended on 19-09-2022

Impact de l’urbanisation sur la structuration des communautés bactériennes construites à partir de phénomènes de spillovers et de coalescence conduisant à l’émergence de souches synurbiques

by Rayan Bouchali supervised by Benoît Cournoyer and Jean-Yves Toussaint . - Lyon 1

Ecologie microbienne

defended on 15-09-2022

Approches bioinformatiques pour l’exploration sans a priori des voies moléculaires chez les espèces non modèles : le cas du métabolisme lipidique chez Gammarus fossarum

by Natacha Koenig supervised by Olivier Geffard and Davide Degli Esposti . - Lyon 1

Bioinformatique et écotoxicologie

defended on 07-09-2022

Relations entre l’évolution des paysages cis-régulateurs, l’évolution de l’expression des gènes et l’évolution phénotypique chez les vertébrés

by Alexandre Laverré supervised by Anamaria Necşulea and Eric Tannier . - Lyon

Génomique évolutive

defended on 13-07-2022

Étude isotopique de populations de Gaule du Nord durant le Second Âge du Fer : climat, alimentation, migrations

by Thibault Clauzel supervised by Christophe Lecuyer and Pascale Richardin . - Lyon

Paléoenvironnements et évolution

defended on 12-07-2022

Estimation of the risk-benefit ratio of antithrombotics in cardiovascular diseases

by Roubi Kilo supervised by Jean-Christophe Lega - Lyon

Pharmacologie clinique/thérapeutique

defended on 07-07-2022

Promoting safe use of medicines in hospitalised children

by Rama Arab supervised by Catherine Cornu - Lyon

Pharamacologie clinique

defended on 07-07-2022

Development and clinical evaluation of new bloodbased tests for improving the diagnosis of pulmonary tuberculosis and identification of candidate biomarkers for treatment monitoring : a multicenter study in moderate and high incidence settings

by Rim Bayaa supervised by Florence Ader and Monzer Hamze . - Lyon

Biologie

defended on 05-07-2022

Approches phylogénétiques multi-niveaux pour l'évolution de l'holobionte

by Hugo Menet supervised by Eric Tannier and Vincent Daubin . - Lyon

Bioinformatique, Biomathématiques

defended on 04-07-2022

Etude des altérations fonctionnelles du système immunitaire des sujets immunodéprimés

by William Mouton supervised by Sophie Trouillet-Assant and Karen Brengel-Pesce . - Lyon

Biologie

defended on 29-06-2022

Modélisation du comportement des saumons atlantiques juvéniles à l’approche d’un ouvrage de franchissement

by Noor Ben Jebria supervised by Hervé Capra - Lyon

Hydroécologie

defended on 23-06-2022

Rôle de peptides antimicrobiens de la famille des « non-specific lipid transfer proteins » dans la symbiose actinorhizienne

by Mélanie Gasser supervised by Hasna Boubakri - Lyon

Microbiologie

defended on 22-06-2022

New insights about LegK4 from Legionella pneumophila

by Quentin Blache supervised by Nathalie Poussereau - Lyon

Infectiologie fondamentale et Biologie moléculaire

defended on 22-06-2022

Etude de l'impact des pratiques d'infiltration des eaux pluviales sur les communautés microbiennes des aquifères souterrains : influence des conditions hydrologiques et des caractéristiques de la zone non-saturée

by Yohan Lebon supervised by Florian Mermillod-Blondin , Laurence Volatier and Clémentine Francois . - Lyon

Biologie

defended on 25-05-2022

Stratégies de repositionnement et combinaisons de médicaments pour le développement de thérapies antivirales contre les virus respiratoires

by Blandine Padey supervised by Manuel Rosa-Calatrava and Mario Andrés Pizzorno . - Lyon

Virologie

defended on 03-05-2022

De la détection en laboratoire à la surveillance épidémiologique en santé animale : difficultés et opportunités à travers l’exemple de deux genres bactériens « orphelins » : Brucella et Mycoplasma

by Maryne Jaÿ supervised by Florence Tardy - Lyon

Microbiologie - épidemiologie

defended on 24-03-2022

Influence of ecological traits on movement of ungulates across environmental gradients : an intra- and interspecific evaluation

by Kamal Atmeh supervised by Christophe Bonenfant and Anne Loison . - Lyon

Ecologie

defended on 21-03-2022

Influence des symbiotes secondaires sur l’utilisation et la sélection de la plante hôte chez l’aleurode du tabac, Bemisia tabaci

by Sylvain Benhamou supervised by Laurence Mouton , Federica Calevro and Fabrice Vavre . - Lyon

Biologie

defended on 10-03-2022

Rôle des voies de signalisation à diGMP cyclique dans le cycle infectieux de Legionella pneumophila

by Corentin Jaboulay supervised by Anne Vianney - Lyon

Microbiologie

defended on 20-01-2022

3 defended theses with the following research partners École Doctorale Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation
Excerpt from most recent:

Epidémiologie analytique de Salmonella enterica subsp. Enterica dans les élevages de poulets de chair : proposition d'une méthode d'estimation du risque de contamination des lots pouvant être intégrée dans des programmes d'assurance qualité

by Nicolas Rose supervised by Pierre Colin - Lyon 1

Sciences. Epidemiologie

defended on 2002

GeMME, une interface modélisant la cartographie comparée des mammifères : application à l'étude de la régionalisation des génomes de l'homme et de la souris

by Bruno Spataro supervised by Christian Gautier - Lyon 1

Sciences

defended on 2001

Origine, devenir et détection rapide de microorganismes entériques pathogènes à l'interface côtière : une application aux genres Salmonella et Cryptosporidium

by Karine Lemarchand supervised by Philippe Lebaron - Lyon 1

Sciences. Écologie microbienne

defended on 2001