Céline Brochier-Armanet
Céline Brochier-Armanet supervised the 4 following theses
Prédiction de liens fonctionnels par détection de coévolution entre familles de gènes : application aux gènes du cycle cellulaire chez les Firmicutes
by Pierre Garcia supervised by Christophe Grangeasse and Céline Brochier-Armanet . - Lyon
Bioinformatique
defended on 18-12-2018
Phylogenomic study of the evolutionary history of the Archaea and their link with eukaryogenesis
by Monique Aouad supervised by Céline Brochier-Armanet and Manolo Gouy . - Lyon
Biologie
defended on 13-11-2018
Phylogénie et évolution des Archaea, une approche phylogénomique
by Celine Petitjean supervised by David Moreira and Céline Brochier-Armanet . - Paris 11
Biologie
defended on 27-09-2013
Phylogénomique des structures multiprotéiques eucaryotes impliquées dans le cycle cellulaire et contribution à la phylogénie des eucaryotes.
by Laura Eme supervised by Céline Brochier-Armanet - Aix-Marseille 2
Biologie, Spécialité Génomique et Bioinformatique
defended on 01-06-2011
Céline Brochier-Armanet was president of the thesis committee the 18 following theses
Détecter et exploiter les flux de gènes dans une biodiversité majoritairement inconnue
by Théo Tricou supervised by Damien de Vienne and Eric Tannier . - Lyon
Evolution
defended on 14-12-2021
Modélisation de l’articulation des mécanismes sélectifs et neutres dans l’évolution des séquences d’ADN codant pour des protéines
by Thibault Latrille supervised by Nicolas Lartillot - Lyon
Génomique évolutive
defended on 30-11-2020
Models and algorithms for investigating and exploiting the metabolism of microorganisms
by Irene Ziska supervised by Marie-France Sagot , Susana Vinga and Mary Arnaud-Arnould . - Lyon
Bioinformatique
defended on 24-11-2020
Adaptation, structural diversity and phylogenetic relevance of a novel functionalized domain-containing membrane architecture in Archaea
by Maxime Tourte supervised by Philippe Oger - Lyon
Microbiologie
defended on 13-11-2020
Anaerobic respiration diversification in Agrobacterium fabrum C58
by Solène Lecomte supervised by Xavier Nesme and Feth-el-Zahar Haichar . - Lyon
Biologie
defended on 18-11-2019
De novo algorithms to identify patterns associated with biological events in de Bruijn graphs built from NGS data
by Leandro Ishi Soares de Lima supervised by Marie-France Sagot , Vincent Lacroix and Giuseppe F. Italiano . - Lyon
Bioinformatique
defended on 23-04-2019
Rôle écologique de la sporulation in-planta dans les symbioses actinorhiziennes : cas de la symbiose Alnus - Frankia
by Guillaume Schwob supervised by Maria P Fernandez and Aude Herrera . - Lyon
Écologie microbienne
defended on 19-03-2018
Utilisation des transferts horizontaux de gènes pour dater des phylogénies
by Adrian Arellano Davin supervised by Vincent Daubin and Bastien Boussau . - Lyon
Phylogénétique moléculaire
defended on 05-12-2017
Phylogénie des dépendances et dépendances des phylogénies dans les gènes et les génomes
by Wandrille Duchemin supervised by Eric Tannier and Vincent Daubin . - Lyon
Biologie
defended on 04-12-2017
Models and algorithms applied to metabolism : from revealing the responses to perturbations towards the design of microbial consortia
by Alice Julien-Laferriere supervised by Marie-France Sagot , Vincent Lacroix and Susana Vinga . - Lyon
BioInformatique
defended on 08-12-2016
Évolution de l’architecture des génomes : modélisation et reconstruction phylogénétique
by Magali Semeria supervised by Eric Tannier and Laurent Guéguen . - Lyon 1
Génomique évolutive
defended on 09-12-2015
Implication des ARN non codant dans la virulence du phytopathogène Agrobacterium fabrum C58
by Magali Dequivre supervised by Florence Hommais - Lyon 1
Micro-organismes. Interactions. Infections
defended on 20-02-2015
Rôles adaptatifs et contraintes de la sporulation chez les microorganismes associés aux plantes : cas de la sporulation in planta dans la symbiose actinorhizienne Frankia (Frankiaceae)–Alnus (Betulaceae)
by Adrien C. Pozzi supervised by Maria P Fernandez and Frédéric Menu . - Lyon 1
Écologie évolutive microbienne
defended on 18-12-2014
Efficient algorithms for de novo assembly of alternative splicing events from RNA-seq data
by Gustavo Akio Tominaga Sacomoto supervised by Marie-France Sagot , Pierluigi Crescenzi and Vincent Lacroix . - Lyon 1
Bioinformatique
defended on 06-03-2014
Les génomes bactériens, une histoire de transferts de gènes, de recombinaison et de cladogénèse
by Florent Lassalle supervised by Xavier Nesme and Vincent Daubin . - Lyon 1
Biologie
defended on 26-11-2013
Résurrection du passé à l’aide de modèles hétérogènes d’évolution des séquences protéiques
by Mathieu Groussin supervised by Manolo Gouy - Lyon 1
Biologie évolutive et évolution moléculaire
defended on 08-11-2013
Recherche automatisée de motifs dans les arbres phylogénétiques
by Thomas Bigot supervised by Guy Perrière - Lyon 1
Bioinformatique
defended on 05-06-2013
Génomique et post-génomique du parasite intestinal Blastocystis sp. sous-type 7. Evaluation de son pouvoir pathogène
by Ivan Wawrzyniak supervised by Catherine Texier - Clermont-Ferrand 2
Microbiologie - Parasitologie
defended on 03-02-2012
Céline Brochier-Armanet was examiner the 4 following theses
Les points de vue des gènes orthologues et paralogues sur la génomique des rongeurs : phylogénomique et évolution des récepteurs olfactifs
by Maxime Courcelle supervised by Emmanuel Douzery - Montpellier
Génétique et génomique
defended on 04-12-2020
De l'annotation automatique des génomes à l'annotation experte pour la génomique environnementale
by Philippe Ortet supervised by Thierry Heulin - Aix-Marseille
Biologie
defended on 25-09-2018
Etude des variations de l'expression génique induites par des perturbations environnementales dans le bassin Durancien : le modèle poisson
by Arnaud Ungaro supervised by Rémi Chappaz , André Gilles and Nicolas Pech . - Aix-Marseille
Sciences de l'environnement. Ecologie
defended on 17-09-2018
Structure et activité des Archaea planctoniques dans les écosystèmes aquatiques
by Mylène Hugoni supervised by Isabelle Mary - Clermont-Ferrand 2
Ecologie Microbienne
defended on 31-10-2013
Céline Brochier-Armanet was thesis committee member the 2 following theses
Approches bioinformatiques pour l’exploration sans a priori des voies moléculaires chez les espèces non modèles : le cas du métabolisme lipidique chez Gammarus fossarum
by Natacha Koenig supervised by Olivier Geffard and Davide Degli Esposti . - Lyon 1
Bioinformatique et écotoxicologie
defended on 07-09-2022
La place des virus dans le monde vivant
by Gladys Kostyrka supervised by Michel Morange and Jean Gayon . - Paris 1
Philosophie
defended on 29-10-2018
