ADN -- Réparation  ADN -- Réplication  ADN double-Brin  ARN ribosomiques  Agrobacterium tumefaciens  Alignements de génomes complets  Analyse cladistique  Antibiothérapie  Antibiotiques  Archée  Archées hyperthermophiles  Archéobactéries  Bacillus subtilis  Bactérie  Bactéries  Bactériophages  Barrière à la dérive  Bioinformatique  Bioinformatique, biologie structurale et génomique  CRISPR  CRISPR  CRISPR-Cas  Chromosome bactérien  Gènes  Génome  Génomique  Génomique comparative  Immunité  Phages  Procaryotes  Recombinaison génétique  Recombinaison homologue  Résistance aux antibiotiques  Transfert génétique  Éléments génétiques mobiles  Évolution  

Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha wrote the following thesis:

Analyse exploratoire des génomes bactériens

by Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha supervised by Antoine Danchin - Versailles-St Quentin en Yvelines

Génétique cellulaire et moléculaire

defended on 2000

Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha supervised the 8 following theses

Tools for massive bacterial comparative genomics : Development and Applications

by Amandine Perrin supervised by Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha - Sorbonne université

Bioinformatique

defended on 21-02-2022

Impact des antibiotiques sur le phageome intestinal humain : de la méthode à l’application

by Camille d' Humières supervised by Erick Denamur and Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha . - Université Paris Cité

Sciences. Génétique

defended on 24-01-2020

Co-option de systèmes moléculaires complexes de la membrane bactérienne et archéenne

by Rémi Denise supervised by Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha - Sorbonne université

Biologie

defended on 04-10-2019

The distribution of CRISPR-Cas systems is affected by interactions with DNA repair pathways

by Aude Bernheim supervised by Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha and David Bikard . - Sorbonne Paris Cité

Microbiologie

defended on 23-11-2017

Evolutionary genomics of conjugative elements and integrons

by Jean Cury supervised by Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha - Sorbonne Paris Cité

Bioinformatique, biologie structurale et génomique

defended on 17-11-2017

L'évolution des phages tempérés d'entérobactéries

by Louis-Marie Bobay supervised by Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha and Marie Touchon . - Paris 6

Biologie

defended on 08-07-2014

Signatures génomiques d'adaptation écologique chez les Bacteria et Archaea

by Sara Manuel Araujo Vieira Da Silva supervised by Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha - Paris 6

Génomique

defended on 2010

Caractérisation et analyse évolutive des répétitions intragéniques : une étude au niveau des gènes, des séquences protéiques et des structures tridimensionnelles

by Anne-Laure Abraham supervised by Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha - Paris 6

Analyse des génomes et modélisation moléculaire

defended on 2008

Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha was examiner the 8 following theses

Une approche éco-évolutive de la propagation de la résistance antibiotique : l'exemple de la résistance aux aminoglycosides

by Léa Pradier supervised by Stéphanie Bédhomme - Université de Montpellier (2022-....)

Sciences de l'évolution et de la Biodiversité

defended on 12-04-2022

Étude du pangénome d’une population bactérienne structurée : vers une nouvelle compréhension de l’origine des variations intra-génomiques

by Hélène Gardon supervised by Corinne Petit-Biderre and Gisèle Bronner . - Université Clermont Auvergne (2021-...)

Bioinformatique

defended on 03-12-2021

Recombinaison et évolution de la composition en base : démonstration expérimentale de la conversion génique biaisée vers GC chez les Bactéries

by Samuel Barreto supervised by Laurent Duret and Franck Bertolla . - Lyon

Biologie

defended on 15-01-2020

L'exploration des génomes par l'outil ICEFinder révèle la forte prévalence et l'extrême diversité des ICE et des IME de streptocoques

by Charles Coluzzi supervised by Nathalie Leblond-Bourget and Gérard Guedon . - Université de Lorraine

Écotoxicologie, biodiversité, écosystèmes

defended on 20-12-2017

Mécanisme moléculaire de reconnaissance et de clivage du génome chez le bactériophage SPP1, un virus à ADN double-brin

by Karima Djacem supervised by Paulo Tavares and Leonor Oliveira . - Université Paris-Saclay (ComUE)

Biochimie et biologie structurale

defended on 08-12-2016

Dynamiques théorique et expérimentale des taux de mutations

by Larissa Viraphong Caudwell supervised by Dominique Schneider and Olivier Tenaillon . - Université Grenoble Alpes (ComUE)

Virologie microbiologie immunologie

defended on 23-10-2015

Statistique des comparaisons de génomes complets bactériens

by Hugo Devillers supervised by Sophie Schbath - Evry-Val d'Essonne

Bioinformatique

defended on 22-02-2011

Les singularités du génome de la paramécie : un bon révélateur des mécanismes évolutifs à l’œuvre chez les êtres vivants

by Jean-François Goût supervised by Laurent Duret - Lyon 1

Biologie

defended on 12-10-2009

Eduardo Pimentel Cachapuz Rocha was thesis committee member the 5 following theses

Impact du nombre de copies d'opéron ribosomiques dans la stabilité du génome chez Escherichia coli

by Sébastien Fleurier supervised by Ivan Matic - Université Paris Cité

Microbiologie

defended on 16-11-2020

Dynamique des génomes du genre Streptomyces

by Jean-Noël Lorenzi supervised by Olivier Lespinet and Pierre Leblond . - université Paris-Saclay

Sciences de la vie et de la santé

defended on 09-06-2020

Eléments génétiques mobiles et évolution génomique chez les Archées Thermococcales

by Catherine Badel supervised by Jacques Oberto - Université Paris-Saclay (ComUE)

Sciences de la vie et de la santé

defended on 02-07-2019

Les génomes bactériens, une histoire de transferts de gènes, de recombinaison et de cladogénèse

by Florent Lassalle supervised by Xavier Nesme and Vincent Daubin . - Lyon 1

Biologie

defended on 26-11-2013

Bioinformatic study of the metabolic dialog between a non-pathogenic trypanosomatid and its endosymbiont with evolutionary and functional goals

by Cecilia Coimbra Klein supervised by Marie-France Sagot and Ana Tereza Ribeiro de Vasconcelos . - Lyon 1

Bioinformatique

defended on 12-11-2013