Gestion des parasites gastro-intestinaux à travers une étude comportementales des zèbres de Grant (Equus quagga boehmi) et conséquences environnementales des traitements antiparasitaires

Ecology, ethology and parasite dynamics in pasturelands : the plains zebra, its gastrointestinal parasites and the coprophagous coleopters

• Auteur / Autrice : Cloé Joly
• Direction : Freddie-Jeanne Richard, Alix Ortega, Pierre Jay-Robert
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie des populations et écologie
• Date : Soutenance le 24/06/2025
• Etablissement(s) : Avignon
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences et agrosciences (Avignon)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Abeilles et environnement (Avignon)
• Jury : Président / Présidente : Thierry Dutoit
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Julie Brunet
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Marion Vittecoq, Mickaël Hedde
• DOI : 10.70675/38f00a3az0372z4276za0f6z744b8be8f956

Mots clés

Mots clés contrôlés

Intestins

Parasites

Comportement social des animaux

Bousiers

Ivermectine

Strongylides

Mots clés libres

Parasites gastrointestinaux

Comportements sociaux

Bousiers

Ivermectine

Strongyles

Gastrointestinal parasite

Social behaviors

Dung beetles

Ivermectine

Strongyles

Résumé

Les années 1970 marquent le début de la commercialisation des principales molécules antiparasitaires. Depuis, les animaux d’élevage sont régulièrement et systématiquement traités, souvent en surdosage. Ces pratiques ont mené à l’apparition de parasites résistants aux antiparasitaires, et à une pollution environnementale importante. Plusieurs études rapportent un impact négatif de cette pollution sur la plupart des arthropodes du sol, dont certains ont un rôle majeur dans le contrôle des parasites d’herbivores présents dans lesdéjections. Les travaux de recherche présentés dans ce manuscrit s’intègrent dans le contexte des parcs zoologiques, dont les activités de divertissement sont aujourd’hui complétées par les missions d’éducation, de bien-être animal, de recherche et de conservation. Nous nous sommes intéressés à l’écologie des pâturages dans des enclos multi-espèces d’herbivores, à travers trois modèles biologiques concernés par l’utilisation d’antiparasitaires : les équidés, leurs parasites gastro-intestinaux et les coléoptères coprophages. Les travaux présentés se sont déroulés selon deux axes principaux d’investigation. Au cours du premier axe, nous avons examiné la relation hôte-parasites chez les Zèbres de Grant (Equus quagga boehmi). Les de trois études présentées utilisent des suivis parasitaires et comportementaux individuels, afin d’améliorer les méthodes de vermifugation raisonnée existantes. Nous nous sommes ainsi intéressés aux prédicteurs de la variation d’excrétion fécale des œufs de strongles, avec ou sans administration d’antiparasitaires. Au cours de cette première partie de thèse, nous avons montré que les comportements sociaux sont déterminants de la vitesse de ré-excrétion après un traitement antiparasitaire. De plus, nous avons mis en évidence l’importance des conditions climatiques, quel que soit l’âge, et l’importance des périodes de bouleversements sociaux chez les jeunes, pour expliquer les variations d’excrétion fécale des œufs de strongles au cours du temps.Au cours du deuxième axe, nous avons examiné comment les diversités d’habitats impactent les communautés de coléoptères coprophages. Parmi les trois études présentées, deux s’appuient sur des méthodes de piégeage in situ et une s’appuie sur des expérimentations en laboratoire incluant l’élevage de l’espèce Onthophagus vacca et la réalisation de tests comportementaux et physiologiques sur cette même espèce. L’objectif de ce second axe était de mettre en évidence le lien entre pratiques de gestion des enclos d’herbivoresÉcologie, éthologie et dynamique parasitaire en pâturages : le zèbre, ses parasites gastro-intestinaux et les coléoptères coprophages et communautés de coléoptères coprophages afin de permettre aux directions des zoos de mieux intégrer les problématiques de conservation de la faune sauvage locale. Au cours de cette seconde partie de thèse nous avons montré que la diversité des herbivores ne semble pas être un facteur de diversité ausein des communautés de coprophages, bien que les herbivores aient accès à la même ressource alimentaire. Nous avons aussi mis en évidence l’importance de l’intensité de l’utilisation du sol sur l’abondance et la diversité de ces communautés. Enfin, dans une dernière étude nous avons abordé la plasticité de l’espèce O. vacca et les mécanismes d’évolution locaux.

The 1970s marked the beginning of the commercializaon of the main anthelmincs. Since then, livestock have been regularly and systemacally treated, oen in overdoses. These pracces have led to the emergence of parasites resistant to anthelmincs, and tosignificant environmental polluon. Several studies report a negave impact of this polluon on most soil fauna, some of which play a major role in the control of herbivore parasites present in feces. The research presented in this manuscript fits into the context of zoological gardens, whose entertainment acvies are today complemented by educaonal, animal welfare, research and conservaon missions. We focused on the ecology of pastures in mul-species herbivore enclosures, through three biological models concerned by the use of anthelmincs: equids, their gastrointesnal parasites and coprophagous beetles. The work presented was conducted along two main lines of invesgaon.In the first line of invesgaon, we examined the host-parasite relaonship in Grant's Zebras (Equus quagga boehmi). The threestudies presented use individual parasite and behavioral monitoring to improve exisng reasoned deworming methods. We wereinterested in the predictors of variaon of the fecal excreon of strongyle eggs, with or without the administraon of anthelmincs.In this first part of the thesis, we showed that social behaviors determine the rate of re-excreon aer treatment. In addion, wehighlighted the importance of climac condions, regardless of age, and the importance of periods of social upheaval among young animals, in explaining variaons of the fecal excreon of strongyle eggs over me. During the second axis, we examined how habitat diversity impacts dung beetle communies. Among the three studies presented, two are based on in situ trapping methods and one is based on laboratory experiments including the breeding of the species Onthophagus vacca and behavioral and physiological tests on this same species. The goal of this second axis was to highlight the link between herbivore enclosure management pracces and dung beetle communies in order to allow zoo management to beer integrate local wildlife conservaon issues. During this second part of the thesis we showed that herbivore diversity does not seem to be a factor of diversity within dung beetle communies, even though herbivores have access to the same food resource. We also highlighted the importance of land use intensity on the abundance and diversity of these communies. Finally, in a last study we addressed the plascity of the species O. vacca and the local evoluonary mechanisms.