Initiation de la répression transcriptionnelle et post-transcriptionnelle chez Neurospora crassa
Auteur / Autrice : | Sebastian Castro Ramirez |
Direction : | Eugene Gladyshev |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Microbiologie |
Date : | Soutenance le 22/04/2024 |
Etablissement(s) : | Université Paris Cité |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Bio Sorbonne Paris Cité (Paris ; 2014-....) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Épigénétique et Génétique Moléculaire |
Structure de recherche : Institut Pasteur. Département de Mycologie (2014-….) | |
Jury : | Président / Présidente : Philippe Silar |
Examinateurs / Examinatrices : Isabelle Fudal, Sylvain Brun | |
Rapporteur / Rapporteuse : Svetlana Dokudovskaya, Fabienne Malagnac |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Résumé
Nos études sur le champignon modèle Neurospora crassa nous ont permis de découvrir un nouveau mécanisme qui déclenche la répression transcriptionnelle et post-transcriptionnel d'un ADN synthétique répétitif (le tetO array) lorsqu'il est lié par des facteurs de transcription. La production de petits ARN produit par ce processus dépend de facteurs connus du Quelling comme QDE-1 (ARN polymérase ARN dépendante) et QDE-3 (hélicase RecQ) mais peut se produire en l'absence de RAD51 et RAD52 ce qui suggère qu'il est indépendant de la recombinaison homologue. Dans ce contexte, nous avons identifié que ce mécanisme était complètement supprimé en délétant un remodeleur de la chromatine SWI/SNF conservé SAD-6/ATRX . En l'absence de cette protéine on observe un appauvrissement en nucléosomes au niveau du locus d'ADN répétitif. La délétion de sad-6 affecte à la fois la production de petits ARN ainsi que l'état de la chromatine du locus d'ADN répété en faisant un acteur clé de notre mécanisme. Ces résultats et d'autres suggèrent un modèle dans lequel l'initiation de ce mécanisme de répression est induite par un processus actif qui rétablit les nucléosomes dans cette région d'ADN répétitif.