Thèse soutenue

Initiation de la répression transcriptionnelle et post-transcriptionnelle chez Neurospora crassa

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Auteur / Autrice : Sebastian Castro Ramirez
Direction : Eugene Gladyshev
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Microbiologie
Date : Soutenance le 22/04/2024
Etablissement(s) : Université Paris Cité
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Bio Sorbonne Paris Cité (Paris ; 2014-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Épigénétique et Génétique Moléculaire
Structure de recherche : Institut Pasteur. Département de Mycologie (2014-….)
Jury : Président / Présidente : Philippe Silar
Examinateurs / Examinatrices : Isabelle Fudal, Sylvain Brun
Rapporteur / Rapporteuse : Svetlana Dokudovskaya, Fabienne Malagnac

Mots clés

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Résumé

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Nos études sur le champignon modèle Neurospora crassa nous ont permis de découvrir un nouveau mécanisme qui déclenche la répression transcriptionnelle et post-transcriptionnel d'un ADN synthétique répétitif (le tetO array) lorsqu'il est lié par des facteurs de transcription. La production de petits ARN produit par ce processus dépend de facteurs connus du Quelling comme QDE-1 (ARN polymérase ARN dépendante) et QDE-3 (hélicase RecQ) mais peut se produire en l'absence de RAD51 et RAD52 ce qui suggère qu'il est indépendant de la recombinaison homologue. Dans ce contexte, nous avons identifié que ce mécanisme était complètement supprimé en délétant un remodeleur de la chromatine SWI/SNF conservé SAD-6/ATRX . En l'absence de cette protéine on observe un appauvrissement en nucléosomes au niveau du locus d'ADN répétitif. La délétion de sad-6 affecte à la fois la production de petits ARN ainsi que l'état de la chromatine du locus d'ADN répété en faisant un acteur clé de notre mécanisme. Ces résultats et d'autres suggèrent un modèle dans lequel l'initiation de ce mécanisme de répression est induite par un processus actif qui rétablit les nucléosomes dans cette région d'ADN répétitif.