Caractérisation moléculaire d'états cellulaires agressifs dans les gliomes et sarcomes pédiatriques

Molecular characterization of aggressive cell states in pediatric gliomas and sarcomas

• Auteur / Autrice : Swann Meyer
• Direction : Marie Castets
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Bioinformatique
• Date : Soutenance le 18/12/2024
• Etablissement(s) : Lyon 1
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale de Biologie Moléculaire Intégrative et Cellulaire (Lyon ; 1999-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon
• Jury : Président / Présidente : Jean-Yves Blay
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Marie Castets, Marie de Tayrac, Cédric Maurange, Catherine Bourgain, Celio Pouponnot
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Marie de Tayrac, Cédric Maurange

Mots clés

Mots clés contrôlés

Rhabdomyosarcome

Cancer -- Thérapeutique

Gliomes

Chez l'enfant

Cancer

Mots clés libres

Cancer pédiatrique

Gliome diffus de la ligne médiane (DMG)

Rhabdomyosarcome

Omiques

Etat cellulaire

Bioinformatique

Pediatric cancer

Diffuse midline glioma (DMG)

Rhabdomyosarcoma

Omics

Cell state

Bioinformatics

Résumé

Bien que considérés comme des maladies rares, les cancers pédiatriques sont la 2e cause de mortalité chez les enfants de moins de 14 ans dans les pays occidentaux. Des progrès considérables ont été réalisés dans les années 1970, avec une survie globale de 70% atteinte en une vingtaine d’années. Néanmoins, certains sous-groupes sont toujours associés à un pronostic sévère, et la question des séquelles dues aux traitements demeure. Ces défis proviennent notamment du fait que la majorité des traitements des cancers pédiatriques ont initialement été développés pour des cancers de l’adulte, alors que l’on sait aujourd’hui qu’ils présentent des particularités, notamment sur le plan biologique. Il est donc important d’identifier les spécificités des cancers pédiatriques pour mieux cibler leurs vulnérabilités. Les travaux de cette thèse ont ainsi porté sur la caractérisation bioinformatique des aspects moléculaires impliqués dans l’agressivité tumorale de deux types de tumeurs pédiatriques : les gliomes diffus de la ligne médiane (DMG) et les rhabdomyosarcomes (RMS). Nous avons identifié des signalisations oncogéniques impliquées dans l’acquisition d’un phénotype invasif dans ces cancers, et caractérisé un nouveau facteur individuel susceptible de jouer un rôle pronostique dans les RMS. Enfin, ces études sont conclues par des réflexions épistémologiques sur le rôle des technologies multi-omiques, ces dernières ayant été centrales tout au long de ces travaux.

Although considered a rare disease, pediatric cancers are the 2nd leading cause of death in children under the age of 14 in Western countries. Considerable progress was made in the 1970s, with an overall survival of 70% achieved in around twenty years. Nevertheless, certain subgroups are still associated with a poor prognosis, and the matter of treatment-related sequelae remains. These challenges partly stem from the fact that the majority of treatments for pediatric cancers were initially developed for adult cancers, even though we now know that they have their own particularities, notably in terms of biology. It is therefore important to identify the specificities of pediatric cancers to better target their vulnerabilities. The work of this thesis focused on the bioinformatic characterization of the molecular components involved in tumor aggressiveness, in two types of pediatric tumors: diffuse midline gliomas (DMG) and rhabdomyosarcomas (RMS). In both cases, we identified oncogenic signals involved in the acquisition of an invasive phenotype, and highlighted a new individual factor likely to play a prognostic role in RMS. Lastly, these studies are concluded by epistemological reflections on the role of multi-omics technologies in oncology, which have been central throughout this work.