La résistance aux antibiotiques dans les pays à ressources limitées : mise en place, efficience et enjeux des systèmes de surveillance clinico-biologique, l'expérience du Laos et de Madagascar
Auteur / Autrice : | Christelle Elias |
Direction : | Philippe Vanhems, François-Xavier Babin |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Santé Publique |
Date : | Soutenance le 09/12/2024 |
Etablissement(s) : | Lyon 1 |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation (Lyon ; 1999-....) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Centre International de Recherche en Infectiologie (Lyon ; 2013-....) |
Jury : | Président / Présidente : Arnaud Friggeri |
Examinateurs / Examinatrices : Philippe Vanhems, Jean-Ralph Zahar, Solen Kernéis, Marisa Haenni, Anna Fournier | |
Rapporteur / Rapporteuse : Jean-Ralph Zahar, Solen Kernéis |
Résumé
La résistance des bactéries aux antibiotiques est un défi majeur de santé publique, particulièrement dans les pays à faible revenu. Ces régions sont vulnérables en raison de facteurs favorisant l’émergence de la résistance bactérienne : prévalence élevée des infections, accès restreint aux outils de diagnostic, environnement propice à la transmission bactérienne et accès insuffisant et/ou inapproprié aux antibiotiques. La surveillance est essentielle pour estimer la propagation de la résistance aux antibiotiques, informer et suivre l’impact des stratégies locales, nationales et mondiales, répondant ainsi au second objectif du plan d’action mondial de l’OMS contre la résistance aux antibiotiques. Cependant, les systèmes de surveillance basés uniquement sur des données de laboratoire sont insuffisants en raison de l’absence d’information sur la prescription des antibiotiques. Les systèmes de surveillance clinico-biologique apportent une réelle valeur ajoutée en fournissant des données épidémiologiques pour guider la pratique clinique et les facteurs contributifs de l’antibiorésistance. Parmi ces systèmes, figure le projet TSARA, mis en place dans dix hôpitaux à Madagascar, qui relie les données biologiques aux données cliniques grâce à un design longitudinal. TSARA permet notamment d’étudier dans quelle mesure les cliniciens tiennent compte des résultats des examens bactériologiques. Les résultats ont montré qu’une majorité des antibiothérapies empiriques étaient à large spectre, appartenant à la catégorie Watch de la classification AWaRe de l’OMS. L’association d’au moins trois antibiotiques et la présence de dispositifs invasifs favorisaient l’adaptation du traitement empirique dès réception des résultats bactériologiques. En revanche, la disponibilité de ces résultats, notamment l’antibiogramme, n’encourageait pas le changement de traitement antibiotique empirique, suggérant une sensibilisation insuffisante des cliniciens aux données de laboratoire. Ces résultats concordent avec une étude transversale réalisée au Laos, montrant que moins d’un patient sur 20 disposait d’une documentation microbiologique lors d’une prescription antibiotique. De plus, cette enquête de prévalence ponctuelle a montré que l’usage des antibiotiques s’élevait à 60 % avec une faible conformité aux recommandations locales, soulignant le besoin accru de sensibilisation, d’éducation et de formation des cliniciens aux outils diagnostics, à la juste prescription des antibiotiques ainsi qu’à la prévention des infections. Ainsi, les systèmes de surveillance clinico-biologique sont capitaux pour identifier les profils et les déterminants des prescriptions antibiotiques dans l’objectif de mettre en place des actions de santé publique pour lutter efficacement contre la résistance aux antibiotiques dans les hôpitaux de pays à ressources limitées. La sensibilisation des acteurs locaux, des programmes éducatifs et la révision des guidelines de bon usage des antibiotiques participent à améliorer l’engagement clinique et optimiser les politiques de santé pour un usage plus responsable des antibiotiques. Pour assurer leur efficience et leur pérennité, ces systèmes reposent toutefois sur une collaboration interdisciplinaire, des financements durables et un leadership important.