Modulation du microbiote des vecteurs pour le contrôle des pathogènes vectoriels

Modulating the vector microbiota for the control of vector-borne pathogens

• Auteur / Autrice : Apolline Maître
• Direction : Alejandro Cabezas-Cruz, Veronica Risco-Castillo
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences agronomiques
• Date : Soutenance le 23/10/2024
• Etablissement(s) : Maisons-Alfort, École nationale vétérinaire d'Alfort
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Agriculture, alimentation, biologie, environnement, santé (Paris ; 2015-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Biologie moléculaire et immunologie parasitaires

Mots clés

Mots clés contrôlés

Thèses et écrits académiques

Tiques -- Vecteurs de maladies

Mots clés libres

Tique

Moustique

Microbiote

Modulation microbienne

Rickettsia

Borrelia

Tick

Mosquito

Microbiota

Microbial modulation

Rickettsia

Borrelia

Résumé

Le cheptel corse, composé d'ovins, de caprins, de porcins et de bovins, est principalement élevé dans des systèmes d'élevage extensifs. Les interactions fréquentes entre le bétail, la faune sauvage et les populations humaines favorisent donc la circulation des tiques et des micro-organismes transmis par les tiques. Une forte prévalence de bactéries transmises par les tiques des familles Rickettsiaceae et Anaplasmataceae a été signalée chez les chèvres (Anaplasma ovis), les moutons (A. ovis), les bovins (Anaplasma marginale, Anaplasma phagocytophilum et Ehrlichia minasensis) et les tiques (Rickettsia spp.) en Corse. Certaines de ces bactéries (par exemple, A. phagocytophilum et Rickettsia sp.) sont zoonotiques et pathogènes pour l'homme. Actuellement, il n'existe pas de mesures préventives pour le contrôle des tiques et des maladies transmises par les tiques. Le microbiome des tiques est un ensemble très complexe de micro-organismes en interaction qui ont un impact sur la physiologie des tiques et leur compétence vectorielle. Récemment, nous avons montré que les vaccins anti-microbiote des tiques peuvent produire une mortalité élevée chez celles-ci pendant leur alimentation. Les vaccins anti-microbiotiques peuvent également moduler le microbiome des tiques et peuvent donc être utilisés comme outil de contrôle de la transmission des pathogènes transmis par les tiques. Dans ce projet, nous utiliserons le séquençage de nouvelle génération des amplicons 16S pour étudier la diversité taxonomique et fonctionnelle du microbiome de Rhipicephalus bursa et Hyalomma marginatum, les principales tiques vectrices de pathogènes chez le bétail en Corse. En utilisant les réseaux de co-occurrence et la détection à haut débit des pathogènes, nous identifierons ensuite les bactéries clés interagissant avec les pathogènes détectés transmis par les tiques. Les bactéries clés de voûte seront utilisées pour formuler des vaccins anti-microbiotiques afin de bloquer l'acquisition et/ou la transmission des pathogènes.

The Corsican livestock population, composed of sheep, goats, pigs and cattle, is mainly raised in extensive farming systems. Frequent interactions between livestock, wildlife and human populations can favor the circulation of ticks and tick-borne microorganisms. A high prevalence of tick-borne bacteria of the families Rickettsiaceae and Anaplasmataceae has been reported in goats (Anaplasma ovis), sheep (A. ovis), cattle (Anaplasma marginale, Anaplasma phagocytophilum, and Ehrlichia minasensis) and ticks (Rickettsia spp.) in Corsica. Some of these bacteria (e.g., A. phagocytophilum and Rickettsia sp.) are zoonotic and pathogenic to humans. Currently, there are no preventive measures for the control of ticks and tick-borne diseases. The tick microbiome is a very complex set of interacting microorganisms that impact tick physiology and vector competence. Recently, we have shown that tick microbiota vaccines can produce high mortality in ticks during feeding. Anti-microbiota vaccines can also modulate the tick microbiome and thus can be used as a tool to control the transmission of tick-borne pathogens. In this project, we will use next-generation sequencing of 16S amplicons to study the taxonomic and functional diversity of the microbiome of Rhipicephalus bursa and Hyalomma marginatum, the main pathogen-vector ticks in cattle in Corsica. Using co-occurrence networks and high-throughput pathogen detection, we will then identify keystone bacteria interacting with the detected tick-borne pathogens. The keystone bacteria will be used to formulate antimicrobial vaccines to block pathogen acquisition and/or transmission.