Etude des parasites de la faune piscicole introduite et autochtone de Corse

Study of parasites of introduced and indigenous fish fauna in Corsica

• Auteur / Autrice : Anaïs Esposito
• Direction : Yann Quilichini, Joséphine Foata
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Physiologie et Biologie des Organismes - Populations - Interactions
• Date : Soutenance le 24/05/2024
• Etablissement(s) : Corte
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Environnement et sociéte (Corte ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Université de Corse (1975-....). UMR CNRS 6134 "Sciences pour l'Environnement" (SPE)
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Yann Quilichini, Joséphine Foata, Cheikh Tidiane Bâ, Jordi Miquel, Bernard Marchand, Sihem Bahri-Ajmi
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Cheikh Tidiane Bâ, Jordi Miquel

Mots clés

Mots clés contrôlés

Corse (France)

Animaux et plantes nuisibles -- Lutte biologique contre

Pisciculture

Mots clés libres

Poissons

Espèces introduites

Parasites

Écosystèmes aquatiques

Milieu insulaire

Fish

Introduced species

Parasites

Aquatic ecosystems

Insular environment

Résumé

La Corse, avec ses 3 000 km de linéaire de cours d’eau, possède un réseau hydrographique particulièrement dense et complexe. A cette complexité vient s’ajouter celle des peuplements piscicoles actuels, fruits de vagues successives d’introductions d’espèces dans les cours d’eau et les plans d’eau de l’île. Si la Corse est caractérisée par une faune piscicole native faiblement diversifiée (seulement quatre espèces), plus d’une vingtaine d’espèces introduites sont venues augmenter artificiellement cette diversité depuis la fin du 19ème siècle. Les impacts des espèces introduites sur les écosystèmes aquatiques sont multiples (e.g., compétition, prédation, modification d’habitat, impacts génétiques) et parmi ceux-ci, la co-introduction de pathogènes, dont les parasites, est particulièrement préoccupante et encore trop faiblement documentée. Il est de plus intéressant d’aborder ce type de sujet en milieu insulaire. Les travaux présentés ici ont par conséquent pour objectifs de déterminer la composition de la parasitofaune des poissons natifs et introduits en Corse, d’évaluer sa richesse, de déterminer si des transferts de parasites des poissons introduits vers les natifs ont pu se produire, et si les parasites présents sont susceptibles d’avoir un impact en termes de santé animale ou humaine.Afin de réaliser ce travail, des campagnes d’échantillonnage ont été réalisées sur une sélection d’espèces natives (Anguilla anguilla, Salmo trutta, Salariopsis fluviatilis et Atherina boyeri) et introduites (vairons du genre Phoxinus, Perca fluviatilis, Squalius cephalus et Gobio spp.), dont quatre ont été particulièrement ciblées en raison de leur accessibilité et des problématiques parasitologiques qu’elles offraient. Ainsi, le travail mené a permis, d’une part, de déterminer la composition des communautés parasitaires d’A. anguilla dans deux lagunes de la plaine orientale et, pour la première fois, dans de nombreux cours d’eau répartis sur l’ensemble du territoire insulaire. D’autre part, ce travail a mis en évidence la présence dans toute la Corse de parasites invasifs : les Monogenea Pseudodactylogyrus bini et P. anguillae et le Nematoda Anguillicola crassus, ainsi que leur maintien et l’augmentation de leur prévalence et abondance dans la lagune de Biguglia depuis la décennie précédente. Ces résultats montrent l’intérêt du suivi des parasites invasifs. L’étude de la truite S. trutta a permis de proposer une détermination spécifique du Gyrodactylus qui provoque des pathologies chez certaines populations de Corse. Pour ce qui est des espèces introduites, les travaux menés chez les Phoxinus ont révélé la présence de quatre espèces de ce genre dans l’île, avec un premier signalement pour Phoxinus csikii et Phoxinus septimaniae. Les parasites des vairons ont été étudiés en Corse pour la première fois et la répartition des Monogenea du genre Gyrodactylus a permis de retracer les voies d’introduction secondaires de leurs hôtes. Ces résultats montrent la nécessité d’une clarté taxonomique pour la parasitologie et l’apport de l’étude des parasites pour la biologie des invasions. Bien que réalisée sur un faible effectif, l’étude des parasites de Perca fluviatilis a révélé la présence de deux parasites zoonotiques chez ce poisson : le Nematoda Eustrongylides spp. et le Digenea Clinostomum complanatum, tous deux rapportés pour la première fois en France, et susceptibles d’impacter la santé de la faune sauvage et la santé humaine. Ces observations confirment la nécessité d’une approche systémique du type One Health pour ce genre de problématique. Des données, moins fournies, ont aussi été apportées pour la première fois sur la parasitologie d’autres espèces introduites et natives de Corse (S. fluviatilis, A. boyeri, S. cephalus et Gobio spp.).

With 3,000 km of waterways, Corsica has a particularly dense and complex hydrographic network. This complexity is compounded by the complexity of current fish populations, which is the result of successive waves of species introductions into the island's rivers and reservoirs. Although Corsica's native fish fauna is poorly diversified (only four species), more than twenty introduced species have artificially increased this diversity since the end of the 19th century. The impacts of introduced species on aquatic ecosystems are multiple (e.g., competition, predation, habitat modification, genetic impacts) and among these, the co-introduction of pathogens, including parasites, is of particular concern and still too poorly documented. Moreover, it is interesting to approach this type of subject in an insular environment. The work presented here therefore aims to determine the composition of the parasitofauna of native and introduced fish in Corsica, to assess its richness, to determine whether transfers of parasites from introduced fish to native fish have occurred, and whether the parasites present are likely to have an impact in terms of animal or human health. Sampling campaigns were carried out on a selection of native species (Anguilla anguilla, Salmo trutta, Salariopsis fluviatilis and Atherina boyeri) and introduced species (Phoxinus minnows, Perca fluviatilis, Squalius cephalus and Gobio spp.), four of which were particularly targeted for their accessibility and the parasitological problems they presented. The work carried out enabled us to determine the composition of A. anguilla parasite communities in two lagoons on the eastern plain and, for the first time, in numerous watercourses throughout the island. In addition, this work has highlighted the presence throughout Corsica of invasive parasites: the Monogenea Pseudodactylogyrus bini and P. anguillae and the Nematoda Anguillicola crassus, as well as their maintenance and the increase in their prevalence and abundance in the Biguglia lagoon since the previous decade. These results demonstrate the value of monitoring invasive parasites. The study of S. trutta trout has enabled us to propose a specific determination of Gyrodactylus, which causes pathologies in certain Corsican populations. As for introduced species, work on Phoxinus has revealed the presence of four species in this genus on the island, with the first records of Phoxinus csikii and Phoxinus septimaniae. Parasites of minnows have been studied in Corsica for the first time, and the distribution of Monogenea (Gyrodactylus) has enabled us to trace the secondary introduction routes of their hosts. These results demonstrate the need for taxonomic clarity in parasitology, and the contribution of parasite studies to invasion biology. Although carried out on a small number of fish, the study of Perca fluviatilis parasites revealed the presence of two zoonotic parasites in this fish: the Nematoda Eustrongylides spp. and the Digenea Clinostomum complanatum, both reported for the first time in France, and likely to have an impact on wildlife and human health. These observations confirm the need for a systemic approach such as One Health to this type of problem. Less extensive data were also provided for the first time on the parasitology of other introduced species and those native to Corsica (S. fluviatilis, A. boyeri, S. cephalus and Gobio spp.).