Régulation et fonction de la Dnmt2 chez Schizosaccharomyces pombe

Regulation and function of Dnmt2 in Schizosaccharomyces pombe

• Auteur / Autrice : Célia Chentouf
• Direction : Pei-Yun Jenny Wu
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie cellulaire, biologie du développement
• Date : Soutenance le 05/05/2023
• Etablissement(s) : Université de Rennes (2023-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Rennes ; 2022-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de Génétique et Développement de Rennes (UMR 6290)
• Jury : Président / Présidente : Anne Royou
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Gilles Charvin
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Anne Royou, André Verdel

Mots clés

Mots clés contrôlés

Méthyltransférases

Instabilité génomique

ARN de transfert

Schizosaccharomyces pombe

Mots clés libres

S.pombe

Trna

Instabilité génomique

Ségragation chromosomique

Méthyltransférase

S.pombe

Trna

Genomic instability

Chromosomes segregation

Methyltransferase

Résumé

Les modifications des nucléotides sont au cœur de nombreux processus biologiques fondamentaux. La méthylation de l’ADN et de l’ARN est l’un des processus les plus étudiés, ainsi que les enzymes chargées d’effectuer ces modifications sur des cibles spécifiques. Il est intéressant de noter que les protéines de la famille Dnmt2 qui possèdent les motifs catalytiques des ADN méthyltransférases (DNMTs), se sont révélées capables de méthyler les ARNt. Malgré la conservation de Dnmt2 chez les eukaryotes, de la levure à l'homme, on sait peu de choses sur ses rôles cellulaires et les voies qui modulent son activité. Au cours de ma thèse, j'ai utilisé la levure de fission Schizosaccharomyces pombe comme modèle pour étudier la fonction et la régulation de Pmt1, l'homologue de Dnmt2 dans cet organisme. Mes travaux ont montré que des niveaux aberrants de Pmt1 ont des impacts significatifs sur la croissance cellulaire, la ségrégation des chromosomes et la maintenance du génome, qui peuvent être liés à des altérations des processus liés à l'ARNt. En outre, mes résultats ont mis en évidence une modulation des niveaux de protéines Pmt1 et une modification post-traductionnelle potentielle par le contexte nutritionnel, en particulier la limitation de l'azote. Dans l'ensemble, mes travaux de thèse apportent de nouvelles perspectives à notre compréhension de la famille des protéines Dnmt2, largement conservées.

Nucleotide modifications are central to many fundamental biological processes. The methylation of DNA and RNA are among the most well-studied, with enzymes dedicated to carrying out distinct modifications on specific targets. Interestingly, the Dnmt2 family of proteins, which possess the catalytic motifs of DNA methyltransferases (DNMTs), have been known to methylate tRNA. Despite the conservation of Dnmt2 across eukaryotes from yeast to human, little is known about its cellular roles and the pathways that modulate its activity. During my thesis, I used the fission yeast Schizosaccharomyces pombe as a model for studying the function and regulation of Pmt1, the homologue of Dnmt2 in this organism. My work showed that aberrantly high levels of Pmt1 give rise to significant impacts on cell growth, chromosome segregation, and genome maintenance that may be linked to alterations in tRNA-related processes. In addition, my results uncovered a modulation of Pmt1 protein levels and potential post-translational modification by nutritional context, specifically nitrogen limitation. Altogether, my thesis work provides new perspectives into our understanding of the widely conserved Dnmt2 family of proteins.