Thèse soutenue

La membrane chorioallantoïque au cours du développement embryonnaire chez le poulet : physiologie et variabilité génétique

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Auteur / Autrice : Maeva Halgrain
Direction : Sophie Rehault-GodbertMaxwell Hincke
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences de la vie
Date : Soutenance le 24/01/2023
Etablissement(s) : Tours
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire ; 2012-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Biologie des oiseaux et aviculture (Tours)
Jury : Président / Présidente : Philippe Roingeard
Examinateurs / Examinatrices : Céline Zatylny-Gaudin, Yohann Wittrant, Anne Duittoz
Rapporteurs / Rapporteuses : Andreas Bikfalvi, Marthe Rousseau

Résumé

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La membrane chorioallantoïque (CAM) est une structure extra-embryonnaire très vascularisée, qui se développe à partir du 5ème jour d'incubation (ED5) sur la face interne de la coquille. Elle englobe toutes les autres structures internes de l'œuf à partir de ED11 et atteint sa maturité cellulaire et fonctionnelle à ED15. La CAM joue un rôle crucial dans l'équilibre acido-basique, les échanges gazeux et l'immunité innée. Elle assure aussi la solubilisation des minéraux de la coquille et leur transport vers l'embryon pour la minéralisation de son squelette. Cependant, les mécanismes cellulaires et moléculaires associés à l'ensemble de ces fonctions physiologiques ne sont, à l'heure actuelle, que peu renseignés.Outre son intérêt d'un point de vue physiologique, une meilleure caractérisation de cette structure pourrait contribuer à l'amélioration des pratiques de production des animaux en filière avicole. En effet, les poulets de chair et les poules pondeuses contemporaines résultent de décennies de sélection sur des critères de productivité (croissance musculaire et production d'œufs), ce qui a entrainé l'apparition de troubles métaboliques et musculo-squelettiques compromettant leur santé et leur bien-être. Compte-tenu des différentes fonctions associées à la CAM, nous avons fait l'hypothèse que sa fonctionnalité pourrait avoir été impactée par ces années de sélection intensive, et qu'elle pourrait également dépendre du sexe de l'embryon.L'objectif principal de ce travail de thèse était de caractériser la CAM d'un point de vue moléculaire et cellulaire au cours du développement embryonnaire, et d'évaluer sa variabilité expressionnelle en fonction de l'origine génétique des œufs et du sexe des embryons. Les fonctions de la CAM étant nombreuses, ce travail s'est focalisé sur les rôles de cette membrane dans la solubilisation des minéraux de la coquille en lien avec la minéralisation du squelette de l'embryon, et dans la protection de l'embryon (immunité innée).Des premiers résultats obtenus sur l'expression par la CAM de gènes susceptibles d'être impliqués dans la décalcification de la coquille et de participer au transport d'ions de la coquille vers l'embryon, ont été complétés dans un deuxième temps par une analyse du transcriptome par RNA-seq. Cette approche à haut débit a permis l'identification de nombreux nouveaux gènes prédits pour être impliqués dans l'acidification locale et le métabolisme du bicarbonate (CA2, CA9, SLC4A1…) nécessaires à la solubilisation des minéraux de la coquille, dans le métabolisme et le transport du calcium (CASR, ANXA2, MGP…), mais aussi dans l'immunité innée (IL1, IL8, CATHL3…), l'angiogenèse ou le métabolisme hormonal. Les résultats ont également permis de démontrer une variabilité expressionnelle de certains gènes en fonction du sexe de l'embryon et de la souche (chair versus ponte). Des analyses par microscopie électronique à balayage et à transmission ont montré que l'acquisition des différentes fonctions de la CAM s'accompagnaient de modifications morphologiques et cellulaires majeures de cette structure, tandis que la face interne de la coquille se dégrade progressivement. En parallèle, la cinétique de minéralisation de l'embryon au cours de son développement a aussi été analysée, in ovo, par imagerie non-invasive (nano-CT) couplée à un logiciel de reconstruction 3D.Outre l'amélioration des connaissances relatives à la physiologie des structures extra-embryonnaires et, en particulier à la CAM, ce travail a permis l'identification de nouveaux acteurs cellulaires et moléculaires associés à ses fonctions et l'obtention de premiers résultats sur sa variabilité expressionnelle en fonction de la génétique. Ces données ouvrent également de nouvelles perspectives pour l'étude des mécanismes de minéralisation du squelette de l'embryon, et pourraient permettre de proposer de nouveaux biomarqueurs à intégrer dans les schémas de sélection génétique, pour limiter l'apparition de phénotypes délétères.