Aptitudes agro-œnologiques des hybrides interspécifiques complexes de vigne : incidence des régions génomiques issues des espèces sauvages du genre Vitis

Agro-oenological aptitudes of complex interspecific vine hybrids : incidence of genomic regions from wild species of the genus Vitis

• Auteur / Autrice : Elsa Chedid
• Direction : Eric Duchêne, Didier Merdinoglu
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences agronomiques
• Date : Soutenance le 10/03/2023
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Santé de la vigne et qualité du vin (Strasbourg)
• Jury : Président / Présidente : Eric Gomes
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Morgane Roth, Anne Friedrich
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Eric Gomes, Evelyne Costes

Mots clés

Mots clés contrôlés

Génétique végétale

Métabolisme -- Génétique

Résistance aux maladies

Vigne

Mots clés libres

Vitis vinifera

Espèces sauvages

QTL

Gènes de résistance

Mildiou

Oïdium

Caractères agronomiques

Vitis vinifera

Wild species

QTL

Resistance genes

Powdery mildew

Downy mildew

Agronomical traits

Résumé

Les espèces du genre Vitis, résistantes aux maladies fongiques sont utilisées comme géniteurs pour la création variétale de vigne. L’introgression des gènes de résistance des espèces sauvages pourrait introduire des caractères culturaux et organoleptiques inattendus. Mon travail a consisté à (1) mettre en évidence les liaisons génétiques entre les gènes de résistance et les déterminants génétiques de caractères agro-œnologiques et (2) mettre en relation l’espèce d’origine et les facteurs impliqués dans ces caractères. Pour cela, j’ai réalisé une analyse génétique et phénotypique sur une population d’hybrides interspécifiques de vigne portant différentes combinaisons de QTL (Quantitative Trait Loci) de résistance au mildiou et à l’oïdium. J’ai établi des cartes génétiques de cette population et identifié des QTL de phénologie, de développement végétatif, de rendement et de composition des raisins. Les liaisons génétiques entre ces différents QTL sont mises en évidence. J’ai décrit la composition des génomes des descendants en fonction de leur origine généalogique et géographique.

Grapevine wild relatives are used in plant breeding as a natural source of resistance to mildews. The introgression of resistance genes into varieties imply a risk of linkage drag around these genes. My work intended to (1) describe the genetic link between resistance genes and the genetic determinism of agronomical and oenological traits and (2) identify the species of origin of these genetic factors. I have conducted a phenotypic and genotypic analyses on one population of interspecific grapevine hybrids carrying different combinations of mildews resistance genes. I constructed high density genetic maps and identified QTL of phenology, vigor, yield components and berry composition. I identified the species of origin of chromosomal regions of the offspring. Finally, I studied the genetic link between all detected QTL.