Thèse soutenue

A smart system for processing and analyzing gastrointestinal abnormalities in wireless capsule endoscopy

FR  |  
EN
Auteur / Autrice : Tan-Sy Nguyen
Direction : Hatem ZaagMarie LuongJohn Chaussard
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Mathématiques
Date : Soutenance le 18/12/2023
Etablissement(s) : Paris 13
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Galilée (Villetaneuse, Seine-Saint-Denis)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire Analyse, géométrie et applications (LAGA) (Villetaneuse, Seine-Saint-Denis) - Laboratoire de traitement et transport de l'information (Villetaneuse, Seine-Saint-Denis)
Jury : Président / Présidente : Faouzi Alaya Cheikh
Examinateurs / Examinatrices : Azeddine Beghdadi
Rapporteur / Rapporteuse : Habib Zaidi, Lu Zhang, Frédéric Dufaux

Résumé

FR  |  
EN

Dans cette thèse, nous abordons les défis liés à l'identification et au diagnostic des lésions pathologiques dans le tractus gatro-intestinal (GI). L'analyse des quantités massives d'informations visuelles obtenues par une capsule vidéo-endoscopique (CVE) qui est un excellent outil pour visualiser et examiner le tractus GI y compris l'intestin grêle, représente une charge considérable pour les cliniciens, entraînant un risque accru de diagnostic erroné. Afin de palier à ce problème, nous développons un système intelligent capable de détecter et d'identifier automatiquement diverses pathologies gastro-intestinales. Cependant, la qualité limitée des images acquises en raison de distorsions telles que le bruit, le flou et l'éclairement non uniforme constitue un obstacle significatif. Par conséquent, les techniques de prétraitement des images jouent un rôle crucial dans l'amélioration de la qualité des images acquises, facilitant ainsi les tâches de haut niveau telles que la détection et la classification des anomalies. Afin de résoudre les problèmes liés à la qualité limitée des images causée par les distorsions mentionnées précédemment, plusieurs nouveaux algorithmes d'apprentissage ont été proposés. Plus précisément, les avancées récentes dans le domaine de la restauration et de l'amélioration de la qualité des images reposent sur des approches d'apprentissage qui nécessitent des paires d'images déformées et de référence pour l'entraînement. Cependant, en ce qui concerne la CVE, un défi significatif se pose en raison de l'absence d'une base de données dédiée pour évaluer la qualité des images. À notre connaissance, il n'existe actuellement aucune base de données spécialisée conçu spécifiquement pour évaluer la qualité vidéo en CVE. Par conséquent, en réponse à la nécessité d'une base de données complète d'évaluation de la qualité vidéo, nous proposons tout d'abord la ''Quality-Oriented Database for Video Capsule Endoscopy'' (QVCED). Ensuite, nos résultats montrent que l'évaluation de la gravité des distorsions améliore significativement l'efficacité de l'amélioration de l'image, en particulier en cas d'illumination inégale. À cette fin, nous proposons une nouvelle métrique dédiée à l'évaluation et à la quantification de l'éclairage inégal dans les images laparoscopiques ou par CVE, en extrayant l'éclairement de l'arrière-plan de l'image et en tenant compte de l'effet de la mise en égalisation de l'histogramme. Notre métrique démontrant sa supériorité et sa performance compétitive par rapport aux méthodes d'évaluation de la qualité d'image avec référence complète (FR-IQA).Après avoir effectué l'étape d'évaluation, nous développons une méthode d'amélioration de la qualité d'image visant à améliorer la qualité globale des images. Le nouvel algorithme est basé sur un mécanisme de l'attention croisée, qui permet d'établir l'interaction d'information entre la tâche de l'extraction du niveau de distorsion et de la localisation de régions dégradées. En employant cet algorithme, nous sommes en mesure d'identifier et de cibler précisément les zones spécifiques des images affectées par les distorsions. Ainsi, cet algorithme permet le traitement approprié adapté à chaque région dégradée, améliorant ainsi efficacement la qualité de l'image. Suite à l'amélioration de la qualité de l'image, des caractéristiques visuelles sont extraites et alimentées dans un classificateur pour fournir un diagnostic par classification. La difficulté dans le domaine de CVE est qu'une partie significative des données reste non étiquetée. Pour relever ce défi, nous avons proposé une méthode efficace basée sur l'approche d'apprentissage auto-supervisé (''Self-Supervised Learning'' ou SSL en anglais) afin d'améliorer les performances de la classification. La méthode proposée, utilisant le SSL basé sur l'attention, ont réussi à résoudre le problème des données étiquetées limitées couramment rencontré dans la littérature existante.