Spectrométrie de mobilité ionique pour la lipidomique du plasma humain : vers la mesure standardisée de sections efficaces de collision
Auteur / Autrice : | Anais George |
Direction : | Corinne Loutelier-Bourhis, François Fenaille |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Chimie |
Date : | Soutenance le 13/11/2023 |
Etablissement(s) : | Normandie |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale normande de chimie (Caen) |
Partenaire(s) de recherche : | établissement co-accrédité : Université de Rouen Normandie (1966-....) |
Laboratoire : Chimie organique, bioorganique : réactivité et analyse (Mont-Saint-Aignan, Seine-Maritime ; 2000-....) | |
Jury : | Président / Présidente : Vincent Levacher |
Examinateurs / Examinatrices : Bruno Le Bizec, Kevin Pagel, Christine Enjalbal, Justine Bertrand-Michel | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Bruno Le Bizec, Kevin Pagel |
Résumé
La métabolomique consiste en l’étude des petites molécules d’un organisme vivant, pour permettre une meilleure compréhension des systèmes biologiques. L’identification des molécules d’intérêt au sein d’extraits biologiques complexes reste un défi majeur. C’est dans ce cadre que de nouvelles avancées sont réalisées pour développer des méthodes d’identification plus fiables et performantes. La spectrométrie de mobilité ionique peut être facilement couplée à la spectrométrie de masse ajoutant ainsi une capacité de séparation et un descripteur supplémentaire, la section efficace de collision ou CCS, prenant en compte la structure tridimensionnelle de l’ion.Différentes technologies IMS sont disponibles et différentes méthodes de détermination des CCS (primaire, sans étalonnage et secondaire, avec procédure d'étalonnage) ont été décrites. Des études sont nécessaires pour vérifier la reproductibilité et la robustesse des mesures de CCS dans ces différentes conditions. Mes travaux de recherche portent sur cette problématique. Dans un premier temps, toutes les sources de déviations affectant la détermination des CCS de lipides ont été étudiées et évaluées. Ainsi, il a été vérifié que les paramètres de source et de mobilité ionique ont un impact négligeable devant la précision actuellement admise de 2%. Dans un deuxième temps, divers étalons commerciaux actuellement utilisés pour la détermination des CCS à l'aide de méthodes secondaires ont ensuite été étudiés. Enfin, la comparabilité des CCS de lipides de plasma humain obtenues à l’aide de trois technologies distinctes, Travelling wave IMS (TWIMS), Drift Tube IMS (DTIMS) and Trapped IMS (TIMS) a été évaluée. Un bon accord a pu être obtenu entre les valeurs de CCS obtenues à l'aide de trois technologies IMS différentes en utilisant le même étalon. Il a été démontré que la constitution de librairies de CCS interopérables est clairement réalisable si des conditions standardisées tant du côté analytique que du côté du traitement des données sont définies et utilisées.Cette étude est donc un pas vers la généralisation de l’utilisation de ce descripteur, ce qui ouvre la voie à de nombreuses autres applications de la mobilité ionique dans des domaines tels que la santé, la nutrition, l’environnement.