Développement d'aptamères pour la détection de biomarqueurs de cancers ovariens dans les urines

Development of the aptamers for detection of ovarian cancer biomarkers in urine

• Auteur / Autrice : Antonija Hanzek
• Direction : Christian Siatka, Anne-Cécile Duc
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biochimie - biologie moléculaire
• Date : Soutenance le 23/06/2023
• Etablissement(s) : Nîmes
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Risques et Société (Nîmes ; 2015-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : CHROME (Nîmes) - Détection- évaluation- gestion des risques CHROniques et éMErgents (CHROME) / Université de Nîmes / CHROME
• Jury : Président / Présidente : Philippe Berta
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Jean-Charles Bres, Frédéric Ducongé, Christophe Hirtz
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Catherine Alix-Panabieres, Eric Peyrin

Mots clés

Mots clés contrôlés

Aptamères

Dépistage

Ovaire -- Tumeurs

Marqueurs biologiques

Méthode SELEX

Analyse d'urine

Mots clés libres

Aptamères

Cancer

Cancer ovarien

Biomarqueurs

Selex

Urine

Aptamers

Cancer

Ovarian cancer

Biomarkers

Selex

Urine

Résumé

Le cancer de l'ovaire est le cancer gynécologique le plus mortel dans le monde. La détection précoce est la clé pour la plupart des cancers, mais pour le cancer de l'ovaire, le diagnostic tardif reste l'un des principaux obstacles au rétablissement et à la survie des patientes avec un taux de mortalité très élevé. À l'heure actuelle, il n'existe pas de test de diagnostic spécifique et suffisamment sensible pour la maladie à un stade précoce. L'objectif du projet CARIBOU (CAncer ovaRIan BiosensOr in Urine) est le développement d'aptamères d'acides nucléiques de haute spécificité pour la détection de biomarqueurs du cancer dans l'urine. La nouvelle méthode utilisée pour obtenir la partie détection du biocapteur, High-Fidelity Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment (Hi-Fi SELEX), est utilisée pour la sélection d'aptamères qui ciblent spécifiquement et avec sensibilité les biomarqueurs. Les biomarqueurs du cancer présents dans l'urine sont stables, permettant une détection facile et homogène. A terme, l'utilisation des aptamères comme outils de diagnostic en biocapteur permettrait de développer un test non-invasif pour une utilisation systématique en première ligne.

Ovarian cancer is the deadliest gynecological cancer in the world. Early detection is the key for most cancers, but for ovarian cancer, late diagnosis remains one of the main obstacles to recovery and survival of patients. Currently, there is no specific and sufficiently sensitive diagnostic test for the disease at an early stage. The objective of the CARIBOU project (CAncer ovaRIan BiosensOr in Urine) is the development of high-affinity nucleic acid aptamers for the detection of cancer biomarkers in urine. The new method used to obtain the detection part of the biosensor, High-Fidelity Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment (Hi-Fi SELEX), is used for the selection of aptamers that specifically and sensitively target biomarkers. Cancer biomarkers present in urine are stable, allowing easy and homogenous detection. Ultimately, the use of aptamers as diagnostic tools in biosensor would make it possible to develop a non-invasive test for systematic first-line use.