Dynamique du virome respiratoire et dysfonction immunitaire : caractérisation dans une cohorte de patients cérébro-lésés
Auteur / Autrice : | Louise Castain |
Direction : | Berthe-Marie Imbert-Marcille, Céline Bodin-Bressollette |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biologie médecine santé |
Date : | Soutenance le 17/10/2023 |
Etablissement(s) : | Nantes Université |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Biologie-Santé (Nantes) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie |
Jury : | Président / Présidente : Emmanuel Montassier |
Examinateurs / Examinatrices : Vincent Foulongne | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Slim Fourati, Florence Morfin-Sherpa |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Résumé
Chez des patients hospitalisés en réanimation et considérés immunocompétents, il existe des altérations immunitaires qui favorisent les infections secondaires bactériennes et virales. Les réactivations des virus HSV et CMV ont notamment été associées à une augmentation de la morbi-mortalité de ces patients. Le diagnostic précoce de ces réactivations est de plus en plus recommandé dans la prise en charge de ces patients, même si les indications de mise en route d’un traitement antiviral sont encore en évaluation. Ces dernières années, l’exploration du virome humain, et notamment la part des Anelloviridae (AV) et plus particulièrement le Torque Teno Virus (TTV), a été proposée pour estimer le niveau d’immunocompétence de patients immunodéprimés à risque d’infections opportunistes. Afin d’identifier des biomarqueurs viraux associés à la dysfonction immunitaire et aux complications infectieuses observée chez ces patients,nous avons caractérisé les réactivations virales dans une cohorte de patients cérébro-lésés hospitalisés en réanimation au CHU de Nantes. A partir de prélèvements sanguins et endotrachéaux, nous avons décrit la réactivation HSV, la dynamique des charges virales (CV) TTV et AV dans les compartiments sanguin et respiratoire et la composition du virome respiratoire. Nos résultats montrent une fréquence élevée des réactivations HSV dans la cohorte, associée à un moins bon devenir neurologique et des CV AV sanguines significativement plus basses chez les patients développant une pneumonie nosocomiale et chez ceux développant un syndrome de détresse respiratoire aigu. L’étude longitudinale du virome respiratoire par métagénomique, vient compléter ces résultats. L’ensemble contribue à une meilleure compréhension des réactivations virales chez les patients cérébro-lésés en réanimation.