Etude informatique des effets cliniques et omiques des modulateurs de CFTR dans la mucoviscidose et recherche de nouvelles cibles

Computational study of the clinical and omic effects of CFTR modulators in cystic fibrosis and search for new targets

• Auteur / Autrice : Matthieu Cornet
• Direction : Véronique Stoven, Isabelle Sermet-Gaudelus
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Bio-informatique
• Date : Soutenance le 13/12/2022
• Etablissement(s) : Université Paris sciences et lettres
• Ecole(s) doctorale(s) : Ecole doctorale Ingénierie des Systèmes, Matériaux, Mécanique, Énergétique (Paris)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre de bio-informatique (Paris, Ile-De-France)
• Partenaire(s) de recherche : établissement de préparation de la thèse : École nationale supérieure des mines (Paris ; 1783-....)
• Jury : Président / Présidente : Zhou Xu
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Véronique Stoven, Isabelle Sermet-Gaudelus, Philippe Laurent Reix
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Zhou Xu, Eric Bonnet

Mots clés

Mots clés contrôlés

Études cliniques

Mucoviscidose

Bioinformatique

Métaomique

Mots clés libres

Approches omiques

Bioinformatique

Mucoviscidose

Etude clinique

Bioinformatics

Omics approaches

Cystic fibrosis

Clinical study

Résumé

La mucoviscidose est une maladie provoquée par une mutation d’un gène produisant une protéine l’absence ou le dysfonctionnement entraine des lésions au niveau des poumons et un déclin des fonctions respiratoires. Le pronostic des patients porteurs de la mutation la plus courante a récemment été grandement amélioré grâce à la mise au point de nouvelles thérapies. Cependant, la réponse à ces traitements n’est pas homogène parmi les patients, et leur mécanisme d’action n’est pas entièrement compris. En particulier, nous ne disposons pas de marqueur biologique ou clinique qui fasse consensus pour mesurer l’effet d’un traitement. L’objectif de cette thèse a été de caractériser les réponses cliniques à ces thérapies, en particulier chez les jeunes patients, ainsi que de mieux comprendre leurs mécanismes d’action au niveau cellulaire.

Cystic fibrosis is a disease caused by a mutation in a gene that produces a protein whose absence or malfunction leads to lung damage and a decline in respiratory function. The prognosis for patients with the most common mutation has recently been greatly improved by the development of new therapies. However, the response to these therapies is not homogeneous among patients, and their mechanism of action is not fully understood. In particular, we do not have a universally accepted biological or clinical marker to measure the effect of a treatment. The objective of this thesis was to characterize the clinical responses to these therapies, particularly in young patients, and to better understand their mechanisms of action at the cellular level.