Thèse soutenue

Fonctionnalisation de surface et développement de biocapteurs SPR microfluidiques pour la détection du Zymoseptoria tritici et de Candida albicans
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Auteur / Autrice : Mohamed Taieb Bakouche
Direction : Jean-Pierre VilcotMohamed Bouazaoui
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Electronique, microélectronique, nanoélectronique et micro-ondes
Date : Soutenance le 10/06/2022
Etablissement(s) : Université de Lille (2022-....)
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de l’ingénierie et des systèmes (Lille)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut d'Electronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie
Jury : Président / Présidente : Boualem Sendid
Examinateurs / Examinatrices : Sylvain Desprez, Deborah Lanterbecq, Sophie Maricot
Rapporteurs / Rapporteuses : Eric Finot, Yoann Roupioz

Résumé

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La détection d’éléments biologiques dans des milieux, qu’ils soient simples ou complexes, peut être réalisée par diverses méthodes analytiques telles qu’ELISA, PCR, QCM… . Parmi celles-ci, la méthode optique qui repose sur l’utilisation de biocapteurs à base de résonance plasmonique de surface (SPR) est présentée comme une technique présentant certains avantages: sensibilité, analyses en temps réel et sans marquage.Les travaux de cette thèse menés dans le cadre du projet Biosens, ont porté sur le développement de biocapteurs SPR sans marqueur biologique pour des applications biomédicales et agricoles. Concernant la mise en œuvre sur le terrain, des capteurs SPR avec microfluidique intégrée ont été développés permettant à terme une utilisation de terrain simplifiée.Afin de s’assurer la spécificité de détection, ce type de capteurs nécessite une fonctionnalisation de la surface qui est, dans notre cas, basée sur des anticorps ou des fragments d'ADN. Deux pathogènes différentes, appartenant au règne fongique, à savoir Candida Albicans et Zymoseptoria Tritici, respectivement dans les domaines médical et agricole, ont été étudiées, détectés et quantifiés.À cette fin, les ligands d'intérêt ont d'abord été immobilisés sur la surface en or des capteurs SPR par couplage amine pour les anticorps et par liaison covalente directe thiol-or pour les monobrins d’ADN. Ensuite, des études d'interaction biologique avec les antigènes complémentaires respectifs et l'ADN ont été menées en temps réel à l'aide de deux systèmes de lecture SPR développés en laboratoire; le premier, fixe, basé sur une interrogation angulaire et le deuxième, portable, fonctionnant selon la configuration spectrale.