Étude des mécanismes de régulation de biogenèse des microARN exprimés par l’Hrepèsvirus associé au sarcome de Kaposi

Study of mechanisms regulating the biogenesis of microRNAs expressed by Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus

• Auteur / Autrice : Monika Vilimova
• Direction : Sébastien Pfeffer
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
• Date : Soutenance le 13/09/2022
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
• Jury : Président / Présidente : Antonin Morillon
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Katia Zanier
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Fatima Gebauer, Adam Grundhoff

Mots clés

Mots clés contrôlés

Régulation génétique

Herpes simplex virus

MicroARN

Mots clés libres

MiARN

Polycistron

Microprocesseur

Co-factor

Régulation post-transcriptionnelle

KSHV

MiRNA

Polycistron

Microprocessor

Co-factor

Post-transcriptional regulation

KSHV

Résumé

Les microARN (miARN) sont d’importants régulateurs de l’expression génique exprimés par presque tous les eucaryotes, ainsi que certains de leurs virus associés. Dans le cadre de ce projet, nous avons étudié la biogenèse d’un cluster de miARN exprimé par un oncovirus humain, l’Herpèsvirus associé au sarcome de Kaposi (KSHV). L’objectif était de caractériser les mécanismes de régulation post-transcriptionnelle qui régissent la maturation ce de cluster. Nous avons démontré que certains des miARN précurseurs (pré-miARN) servent d’éléments régulateurs en cis et sont nécessaires pour l’expression de la totalité du cluster. En se basant sur ces résultats, nous avons développé une méthode d’inhibition globale de l’expression du cluster. Finalement, nous avons également étudié l’implication de potentiels co-facteurs HNRL1 et SUGP1 qui pourraient réguler la biogenèse des miARN en trans.

MicroRNAs (miRNAs) are important regulators of gene expression expressed by almost all eukaryotes and also some of their associated viruses. In this project, we have focused on the biogenesis of a miRNA cluster expressed by the human oncovirus, Kaposi’s sarcoma associated herpesvirus (KSHV), with the aim to decipher the post-transcriptional molecular mechanisms controlling their processing. We have shown that some of the viral precursor miRNAs (pre-miRNAs) can act as cis regulatory elements and are required for the optimal processing of the remaining pre-miRNAs within the cluster. An approach to inhibit the global expression of the cluster was developed based on these findings. In addition, we were interested in potential implication of protein co-factors HNRL1 and SUGP1 that could regulate the miRNA expression in trans.