Étude de la biogenèse et des fonctions des petits ARN non codants dérivant d'ARN de transfert chez Arabidopsis thaliana
Auteur / Autrice : | Marjorie Chery |
Direction : | Laurence Drouard |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie |
Date : | Soutenance le 29/06/2022 |
Etablissement(s) : | Strasbourg |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Institut de biologie moléculaire des plantes (Strasbourg) |
Jury : | Président / Présidente : Claire Remacle |
Examinateurs / Examinatrices : Christine Lelandais-Brière, Dominique Gagliardi | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Claire Remacle, Rémy Merret |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Résumé
Les petits ARN non codants dérivant des ARN de transfert (tRFs) ont été identifiés dans tous les domaines de la vie et sont impliqués dans des mécanismes biologiques variés. Mon travail de thèse, mené sur la plante modèle Arabidopsis thaliana, a eu pour but de mieux comprendre la biogenèse des tRFs et leurs fonctions chez les plantes. Des lignées stables n’exprimant pas les trois principales RNases T2, RNS1, 2 et 3, acteurs majeurs de la biogenèse des tRFs, ont été réalisées avec la technologie CRISPR/Cas9. De plus, le tRF-5D Ala (AGC) de 20 nucléotides, montré précédemment comme inhibant la traduction in vitro, a été utilisé comme modèle pour déterminer sa fonction. Des protoplastes d’A. thaliana ont été transfectés avec ce tRF pour observer sa localisation subcellulaire et identifier ses partenaires protéiques. Celui-ci est retrouvé accumulé dans des foci cytosoliques qui ne s’apparentent pas à des mitochondries, P-bodies ou granules de stress. Une hélicase ARN,DExH1, interagissant avec des G-quadruplex, a été retrouvée associée avec le tRF Ala et la présence de structure en G-quadruplex sur le tRF Ala a été confirmée in vitro. Les résultats obtenus suggèrent que le tRF Ala structuré en G-quadruplex peut être stocké dans la cellule et que DExH1 interviendrait pour le relâcher sous forme non structurée.