Synthèse de sondes pour le piégage sélectif de produits naturels

Probes for selective labeling of natural products

• Auteur / Autrice : Victor Flon
• Direction : Xavier Franck, Soizic Prado
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Soutenance le 13/12/2022
• Etablissement(s) : Normandie
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale normande de chimie (Caen)
• Partenaire(s) de recherche : Établissement de préparation : Institut national des sciences appliquées Rouen Normandie (Saint-Etienne-du-Rouvray ; 1985-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Chimie organique, bioorganique : réactivité et analyse (Mont-Saint-Aignan, Seine-Maritime ; 2000-....)
• Jury : Président / Présidente : Thomas Lecourt
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Xavier Franck, Soizic Prado, Laurent Evanno, Véronique Éparvier, Frédéric Taran, Stéphane Leleu
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Laurent Evanno, Véronique Éparvier

Mots clés

Mots clés contrôlés

Réactions chimiques

Chimiosélectivité

Spectrométrie de masse

Chromatographie en phase liquide

Bioconjugués

Synthèse organique

Produits naturels

Mots clés libres

Bioconjugaison

Réseaux moléculaires

Déréplication

Natural products

Organic synthesis

Bioconjugation

Liquid chromatography

Mass spectrometry

Molecular networking

Dereplication

Chemical reactions

Résumé

La découverte de nouveaux produits naturels (PNs) présente un intérêt dans de nombreux secteurs d’applications : pharmaceutique, cosmétique voire agroalimentaire. En effet, les PNs peuvent posséder des activités biologiques ou propriétés physico-chimiques innovantes (fluorescence, pigments). Cependant, l’identification des PNs par les techniques classiques de purification et d’analyse est un processus qui peut être limité par leur faible concentration dans les milieux complexes dont ils sont issus. En collaboration avec l’équipe du Pr. Soizic Prado (UMR 7245 MNHN), nous avons comme objectif d’isoler et d’identifier de nouveaux PNs minoritaires dans des extraits bruts fongiques. Pour cela, une approche basée sur la réactivité chimique a été utilisée, conduisant à l’élaboration de plusieurs sondes. Ces sondes ont été préparées pour contenir conjointement une fonction chimique réactive ainsi qu’une étiquette visant à augmenter la sensibilité de détection lors des analyses par chromatographie et spectrométrie de masse. La synthèse et l’utilisation de ces outils de marquage chimiosélectifs a ainsi permis la capture, l’isolement puis l’identification de nouveaux PNs lors du criblage de divers extraits bruts fongiques.

The discovery of new natural products (NPs) is of interest in many application sectors: pharmaceuticals, cosmetics and even agri-food. Indeed, NPs can have innovative biological activities or physicochemical properties (fluorescence, pigments). However, the identification of NPs by conventional purification and analytical techniques is a process can be limited by their low concentration in complex media from which they come. In collaboration with the team of Prof. Soizic Prado (UMR 7245 MNHN), we aim to isolate and identify new NPs in crude fungal extracts. For this, an approach based on chemical reactivity was used leading to the development of several probes. These probes have been developed to jointly contain a reactive chemical function and a tag to increase detection sensitivity for analysis by chromatography and mass spectrometry. The synthesis and application of these chemoselective labeling tools has allowed the capture, isolation and identification of new NPs during the screening of various fungal crude extracts.