Thèse soutenue

Écologie et conservation des aloses de la façade atlantique dans un contexte global changeant : apports d’un modèle mécaniste de distribution
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Auteur / Autrice : Camille Poulet
Direction : Géraldine LassallePatrick Lambert
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Écologie évolutive, fonctionnelle et des communautés
Date : Soutenance le 24/03/2022
Etablissement(s) : Bordeaux
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences et Environnements (Pessac, Gironde)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (Bordeaux)
Jury : Président / Présidente : Éric Feunteun
Examinateurs / Examinatrices : Pedro raposo De Almeida, Bernard Hugueny, Mathieu Buoro, Lise Comte, Marie Nevoux
Rapporteurs / Rapporteuses : Pedro raposo De Almeida, Bernard Hugueny

Résumé

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La grande alose et l’alose savoureuse sont deux espèces migratrices anadromes emblématiques des façades bordant l’Océan Atlantique Nord, dont les populations ont subi une chute drastique de leurs effectifs au cours du siècle dernier. La mise en oeuvre de politiques de conservation adaptées est primordiale pour assurer le rétablissement et la pérennité de ces populations et des services écosystémiques qu’elles fournissent, mais cela nécessite, au préalable, de lever certains « verrous » dans les connaissances relatives à leur dynamique de populations et leur mode de vie, notamment en mer. Les modèles mécanistes de distribution d’espèces constituent des outils privilégiés dans la résolution de ces « lacunes de connaissances » ou « knowledge gaps » en anglais, puisqu’ils permettent d’explorer la dynamique de populations à large échelle spatio-temporelle et de tester différents scénarios et/ou hypothèses écologiques relatives à leur mode de vie, souvent difficiles à évaluer dans la nature. Dans cette étude, le modèle mécaniste de distribution GR3D (Global Repositionning Dynamics for Diadromous fish Distribution), développé pour la grande alose en Europe de l’Ouest, a été adapté à l’écologie de l’alose savoureuse sur la côte Est des Etats-Unis. L’application du modèle GR3D à cette espèce a nécessité la conceptualisation d’un nouvel environnement marin dans lequel les individus effectuent des migrations trophiques en mer. De plus, l’exploration du modèle GR3D US au travers d’une analyse de sensibilité a souligné l’importance de la dispersion et des effets dépensatoires dans la structuration des populations. Concernant la grande alose, le développement d’un calculateur au sein du modèle GR3D EU, nécessitant la discrimination entre mâles et femelles, a fourni une première quantification du service de régulation (c’est-à-dire flux de nutriments) opéré par cette espèce à l’échelle de son aire de distribution. Enfin, une approche d’écologie comparative, simulant la dynamique des deux espèces sur les deux côtes de l’Océan Atlantique, a permis de statuer plus avant sur le rôle joué par la température et la dispersion dans la distribution des alosinés et leur fonctionnement en métapopulation. Ces apports au sein du modèle GR3D ont permis d’apporter de nouvelles connaissances sur l’écologie générale de chacune des espèces ainsi que sur les mécanismes à l’origine de la distribution et de la structuration des populations de part et d’autre de l’Océan Atlantique. L’ensemble de ces résultats suggèrent que les mesures de conservation de ces deux espèces devraient tenir compte de la connectivité entre les différentes populations constitutives de métapopulations.