Thèse soutenue

Profils respiratoires et allergiques depuis la naissance et facteurs associés en population générale française : résultats de la cohorte ELFE (Etude Longitudinale Française depuis l'Enfance)
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Auteur / Autrice : Sadia Khan
Direction : Chantal Raherison
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Santé publique Option Epidémiologie
Date : Soutenance le 14/01/2022
Etablissement(s) : Bordeaux
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sociétés, politique, santé publique (Bordeaux)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Bordeaux population Health
Jury : Président / Présidente : Mathieu Molimard
Examinateurs / Examinatrices : Chantal Raherison, Mathieu Molimard, Nolwenn Le Meur-Rouillard, Alain Didier, Aurore Gely-Pernot
Rapporteurs / Rapporteuses : Nolwenn Le Meur-Rouillard, Alain Didier

Mots clés

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Résumé

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La cohorte ELFE (2011) a recruté 18 329 enfants dans 320 maternités à travers la France avec des objectifs multidisciplinaires ; l'un d'entre eux étant de mieux comprendre les trajectoires respiratoires et allergiques en population générale. Afin d'atteindre l'objectif fixé, les analyses ont été menées en 3 parties : • Identifier les cas et les témoins pour l'étude cas-témoins (EBRA-ELFE) - L'effet de l'exposition domestique à de multiples micro-organismes au début de la vie sur le développement ultérieur de l'asthme n'est toujours pas résolu, probablement en raison du manque d'études utilisant un échantillonnage standardisé et une analyse environnementale ciblée. En 2011, la cohorte ELFE a déposé une procédure d'échantillonnage standardisée : collecteur de poussière électrostatique (EDC), dans les chambres à coucher de 3193 enfants à la naissance et ensuite analysé par qPCR pour 20 cibles (moisissures, acariens, bactéries etc.) basées sur le rôle allergène ou potentiellement protecteur dans les maladies allergiques. 27%- 88% de moisissures, 92-98% de bactéries et 48% d'acariens ont été détectés dans les logements et sur la base de 6 espèces de champignons, 1 famille et 2 genres de bactéries et 1 acarien, 6 profils de logements différents à travers la France ont été établis. Une nouvelle collecte de poussières de la cohorte après 5 ans de suivi, a été mise en place pour analyser les profils microbiologiques à l'âge de 5 ans, sur la même population sous la forme d'une étude cas témoins nichée au sein de la cohorte (60 enfants asthmatiques vs 60 non asthmatiques). La sélection des cas-témoins a été effectuée à partir de la population qui avait un EDC viable à la naissance (2011) et à l'âge de 5 ans (N= 1 753 ; 52% de garçons, 15% d'asthmatiques et 8% de propriétaires d'animaux). La détermination des cas était basée sur le diagnostic d'asthme, l'utilisation d'un inhalateur et les crises de sifflements (n=67). En revanche, les témoins étaient absolument exempts de maladie et de symptômes (non asthmatiques, pas d'hospitalisation pour des problèmes respiratoires, pas de toux, de rhinite, etc.) de la naissance à l'âge de 5 ans (n=402). Les cas et les témoins ont été appariés individuellement en fonction de la saison et de la région d'habitation. La vérification des profils microbiologiques des logements des cas et des témoins déterminés à l'âge de 5 ans est actuellement en cours par l’équipe de Besançon. • Étude de validation externe d'un score prédictif non invasif de l'asthme La présentation hétérogène des symptômes d'asthme peut contribuer au sous-diagnostic et au traitement de l'asthme préscolaire, ainsi qu'à l'augmentation de la morbidité et des hospitalisations des enfants asthmatiques sévères. Compte tenu de l'augmentation mondiale de la prévalence de l'asthme infantile, il est donc nécessaire de disposer d'outils pronostiques efficaces pour aider les praticiens. La Leicestershire Respiratory Cohort (LRC) a validé un outil simple et non invasif de prédiction de l'asthme en 10 points, facilement utilisable lors d'une seule consultation médicale. L'outil de prédiction de l'asthme a fourni à la cohorte ELFE une occasion unique de déterminer son utilité dans une grande population préscolaire présentant des symptômes hétérogènes. Nous avons constaté que l'outil LRC avait une bonne discrimination et une bonne calibration et qu'il était robuste aux modifications des critères d'inclusion et de résultats. • Identifier et caractériser les phénotypes de sifflements chez l’enfant d’âge préscolaire et de l'asthme et détailler leurs caractéristiques de 0 à 5 ans. Le phénotypage de l'asthme au début de la vie reste difficile à appréhender chez l’enfant. En France, le phénotypage de l'asthme pédiatrique sévère a fait l’objet de publications ; avec des résultats parfois divergents [...].