Développement de protocoles protéomiques en entomologie médicale pour l’identification des arthropodes par MALDI-TOF MS et la détection de leurs microorganismes

Development of proteomic protocols in medical entomology for the identification of arthropods by MALDI-TOF MS and the detection of their associated microorganisms

• Auteur / Autrice : Hanene Benyahia
• Direction : Philippe Parola
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie santé. Maladies infectieuses
• Date : Soutenance le 25/11/2022
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Vitrome (Marseille) - Méditerranée Infection
• Jury : Président / Présidente : Arezki Izri
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Anna Cohuet, Jérôme Depaquit

Mots clés

Mots clés contrôlés

Épidémiologie

Spectrométrie de masse MALDI

Tiques -- Vecteurs de maladies

Protéomique

Microorganismes -- Analyse

Arthropodes

Mots clés libres

Arthropodes

Maldi-Tof ms

Mise au point

Microorganismes

Épidémiologie

Protéomique.

Arthropods

Maldi-Tof ms

Standardization

Microorganisms

Epidemiology

Proteomics

Résumé

Les arthropodes hématophages tels que les moustiques, les tiques, les puces et les poux ont une importance significative en santé publique en raison de leur capacité dans la transmission biologique active des bactéries, des virus et des parasites. Ces agents infectieux sont responsables de maladies majeures chez les humains et les animaux. Nos travaux ont porté sur l’identification morphologique et par MALDI-TOF MS des arthropodes et leur microorganismes associés par biologie moléculaire. La 1ere partie de ce travail est consacrée aux outils innovants pour l’identification des arthropodes. Nous avons mis au point et amélioré des protocoles identification par MALDI-TOF MS des poux et puces de notre élevage , conservés dans de l’éthanol 70% à différents temps et suivre l’évolution de leur profil MS en fonction de temps de conservation, allant de quelques mois jusqu'à 4 ans.La 2éme partie de notre travail est consacrée à l’épidémiologie des microorganismes à transmission vectorielle. D’une part, nous sommes intéressés à l’identification morphologique et par l’outil MALDI-TOF MS des tiques Hyalomma collectées sur des tortues du genre Testudo graeca nabeulensis en Algérie. D’autre part, nous sommes intéressés à leurs microorganismes associés. Nous avons détecté Borrelia turcica,Rickettsia africae,Rickettsia aeschlimannii,Rickettsia sibirica mongolitimonae, ainsi qu’une potentielle nouvelle espèce non décrite d’Anaplasmataceae, proche à Ehrlichia sp. Enfin, nous avons rédigés une revue sur les tiques de tortues terrestres et leur microorganismes associés dans le monde.

Hematophagous arthropods such as mosquitoes, ticks, fleas, and lice are of significant public health importance because of their capacity for active biological transmission of bacteria, viruses and parasites. The latter is achieved through the correct and accurate identification of arthropods and the characterization of the associated pathogen repertoire. Our work focused on the morphological and MALDI-TOF MS identification of arthropods and their associated microorganisms by molecular biology. The 1st part of this work is devoted to innovative tools for the identification of arthropods. We have developed and improved protocols for the preparation of samples for identification by MALDI-TOF MS of lice and fleas from our farm in the laboratory and collected in the field in Algeria, preserved in 70% ethanol at different times and following the evolution of their MS profile according to the time of conservation, ranging from a few months to 4 years.The 2nd part of our work is devoted to the epidemiology of vector-borne microorganisms. First, we are interested in the morphological and MALDI-TOF MS identification of ''Hyalomma aegyptium'' ticks collected from turtles of the genus ''Testudo graeca nabeulensis'' in the extreme north-east of Algeria and preserved in 70% ethanol. Secondly, we are interested in the microorganisms associated with them. We have detected different bacteria by molecular biology tools: Borrelia turcica, Rickettsia africae, Rickettsia aeschlimannii, Rickettsia sibirica mongolitimonae, as well as a new potential undescribed species of Anaplasmataceae, close to Ehrlichia sp.