Thèse soutenue

Scans adaptatifs et ablations cellulaires sur les éphithéliums

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Auteur / Autrice : Huicheng Meng
Direction : Loïc Le GoffSophie Brasselet
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Physique et sciences de la matière. Optique, photonique et traitement d'image
Date : Soutenance le 01/04/2022
Etablissement(s) : Aix-Marseille
Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Physique et sciences de la matière (Marseille)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut Fresnel (Marseille, France)
Jury : Président / Présidente : Martine Ben Amar
Examinateurs / Examinatrices : Ting Zhang
Rapporteurs / Rapporteuses : Nadine Peyriéras, Jacques Pécréaux
DOI : 10.70675/bc86ab16zbfa0z47f7zbb44z8a628d1d07ef

Résumé

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La taille et la forme d'une cellule ou d'un tissu en croissance sont en partie imposées par la mécanique. Pour quantifier la mécanique des tissus, différents outils ont été développés pour mesurer l'impact des forces mécaniques à l'échelle des cellules et des tissus. L'ablation laser utilise un laser pulsé nano-ou femto-seconde pour détruire localement les structures cellulaires et déduire des informations sur la tension initialement supportée par la structure par la mesure de la relaxation qui s'en suit. Cependant, la plupart des spécimens biologiques sont des structures tridimensionnelles, ce qui rend très difficile les ablations multicellulaires car le laser d'ablation ne peut être facilement dirigé que bidimensionnellement dans le plan focal de la lentille d'imagerie. Nous avons construit un système d'imagerie et d'ablation laser sur mesure qui adapte son schéma de balayage à la forme incurvée des monocouches cellulaires, qui sont des structures courantes dans les embryons et les organes en développement. La surface de la monocouche est d'abord estimée à l'aide d'informations 3D à haut contenu provenant d'un microscope confocal à disque rotatif (spinning disc). Ensuite, un laser d'ablation femto-seconde proche infrarouge (fs-NIR) est balayé le long d'une trajectoire 3D sur la surface pour perturber localement les structures cellulaires. Nous démontrons également qu'en l'absence d'un spinning disc, on peut estimer une surface d'intérêt à partir d'un balayage rapide du volume avec le seul laser NIR en mode Lissajous