Mise au point et utilisation d’outils innovants en entomologie médicale et en malacologie : approche moléculaire et protéique

Development and use of innovative tools in medical entomology and malacology : molecular and protein approach

• Auteur / Autrice : Fatima Zohra Hamlili
• Direction : Philippe Parola
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie santé. Maladies infectieuses
• Date : Soutenance le 03/03/2022
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Vitrome (Marseille) - Méditerranée Infection
• Jury : Président / Présidente : Arezki Izri
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Christelle Pomares, Pierre Marty

Mots clés

Mots clés contrôlés

Wolbachia

Spectrométrie de masse MALDI

Schistosomiase

Punaise des lits

Microorganismes

Arthropodes

Relations virus-vecteur

Mots clés libres

Hôte intermédiaire

Schistosomiase

Maldi-Tof ms

Arthropodes

Microorganismes

Punaise d’hirondelle

Punaise de lit

Wolbachia

Intermediate host

Schistosomiasis

Maldi-Tof ms

Arthropods

Microorganisms

Swallow bug

Bed bug

Wolbachia

Résumé

Cette thèse se divise en deux grands axes. Le premier concerne l’utilisation du MALDI-TOF MS en malacologie en mettant au point un protocole adapté à l’identification des différentes espèces de mollusques y compris les hôtes intermédiaires des schistosomes et le deuxième est consacré à d’autres axes en entomologie médicale. En collaboration avec l’équipe de parasitologie de Dakar, nous avons mis au point un protocole MALDI-TOF MS qui permet l'identification rapide des mollusques d'eau douce congelés et un autre protocole adapté aux mollusques conservés dans l'éthanol 70%. Dans un deuxième temps, nous avons rapporté pour la première fois en France un cas d’infestation humaine par les punaises d’hirondelles (Cimex hirundinis). Nous avons, par la suite, utilisé le MALDI-TOF MS pour identifier cette espèce et évaluer l’efficacité de l’approche pour distinguer les nymphes des adultes. Également, nous avons détecté pour la première fois la nouvelle souche de Wolbachia (Wolbachia massiliensis) infectant les Cimex hirundinis. Nous avons aussi mené une étude sur les tiques de dromadaires du sud-est d’Algérie afin d’éprouver une nouvelle fois la capacité du MALDI-TOF MS pour l'identification des tiques, d’incrémenter la base de données de notre laboratoire par des spectres des tiques conservées dans l’éthanol 70% et accroitre notre connaissance sur les microorganismes associés à ces tiques.Nos travaux, présentés dans cette thèse, mettent en évidence l’importance de l’utilisation du MALDI-TOF MS en entomologie médicale et en malacologie en l’occurrence dans le cadre de la surveillance épidémiologique.

This thesis is divided into two main axes. The first axis concerns the use of MALDI-TOF MS in malacology and the second axis concerns the use of this tool in medical entomology. Therefore, the first objective of this thesis was to standardize a protocol for the identification of different species of freshwater snails including the intermediate hosts of schistosomes. The second objective was to use this high-throughput approach to increment our MS database with spectra of hematophagous arthropods. In the first project, we optimized an MS protocol for the rapid and correct identification of frozen and ethanol-preserved freshwater snails without requiring any malacological expertise. In the second step of the thesis, we reported for the first time in France a case of human infestation by swallow bugs (Cimex hirundinis). Moreover, we used MALDI-TOF MS to assess its ability to identify this species and compared it with laboratory-reared bed bugs. The effectiveness of the approach to distinguish nymphs from adults was evaluated as well. We also detected the novel strain of Wolbachia (Wolbachia massiliensis) infecting Cimex hirundinis. Our particular interest in Cimicids led us to write a literature review on Cimicidae of medical and veterinary importance.Finally, we conducted a study on dromedary ticks from South-Eastern Algeria in order to enrich our MS database with spectra of ticks preserved in 70% ethanol and detect their associated microorganisms using molecular tools.