Etude des dynamiques spatiales et télé-épidémiologie des maladies infectieuses et émergentes en Guyane

Study of the spatial dynamics and tele-epidemiology of infectious and emerging diseases in French Guiana

• Auteur / Autrice : Sarah, Marie, Jeanne Bailly
• Direction : Claude Flamand
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Santé publique
• Date : Soutenance le 27/09/2021
• Etablissement(s) : Guyane
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Diversités, santé et développement en Amazonie (Cayenne)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Ecole Doctorale 587 : Diversités, santé et développement en Amazonie
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Mathieu Nacher, Anubis Vega Rua, Lucie Léon, Magalie Pierre Demar
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Mathieu Nacher, Anubis Vega Rua

Mots clés

Mots clés contrôlés

Maladies infectieuses -- Prévention

Guyane

Épidémiologie

Mots clés libres

Dengue

Zika

Chikungunya

Mayaro

Fièvre jaune

Fièvre Q

Télé-épidémiologie

Aedes

Dengue fever

Zika

Chikungunya

Mayaro

Yellow fever

Q fever

Tele-epidemiology

Aedes

Résumé

La surveillance, la prévention et la lutte contre les maladies infectieuses et émergentes, se font par le biais d’actions de santé publique diverses. Pour les mettre en œuvre, il est nécessaire de connaître les dynamiques spatio-temporelles de ces maladies en identifiant leurs déterminants environnementaux, climatiques et socio-économiques. Pour cela, des outils tels que la télé-épidémiologie peuvent contribuer à la surveillance et à la prévention d’éventuelles épidémies. Ces quinze dernières années, les épidémies de dengue se sont intensifiées en nombre et les virus du chikungunya et du virus Zika ont émergé en Guyane. Dans le même temps, d’autres maladies infectieuses telles que l’infection au virus Mayaro, la Fièvre Q ou encore la Fièvre jaune, continuent de se transmettre sur le territoire guyanais. L’objectif général de la thèse a été d’étudier la dynamique spatiale de ces maladies en vue de connaître et de mieux comprendre leurs déterminants environnementaux. Un premier travail de caractérisation de la répartition spatiale de la séroprévalence des arbovirus a été réalisé sur l’ensemble du territoire grâce à une large enquête en population générale. Cela nous a montré, de façon surprenante, que le risque de transmission des arbovirus était plus élevé dans la région du Maroni, le long de la frontière Surinamienne. Cette zone du territoire apparaît comme une cible privilégiée pour les actions de prévention, de lutte anti-vectorielle mais également pour les campagnes de rattrapage vaccinal contre la fièvre jaune. Les différentes études réalisées ont aussi permis de mettre en avant les facteurs environnementaux et socio-économiques augmentant les risques d’être infectés par ces maladies. La seconde partie des travaux a eu pour objectif la modélisation et la cartographie du risque de présence/absence de larves d’Ae. aegypti, principaux vecteurs des arboviroses en Guyane. Les variables environnementales télédétectées et les paramètres météorologiques ont permis de créer une base de données dans laquelle six prédicteurs se sont détachés. L’intégration de ces prédicteurs dans un modèle statistique et son extrapolation ont permis de produire des cartes prédictives de la présence/absence de larves d’Ae. aegypti dans les trois communes de l’Ile de Cayenne. Les différents résultats obtenus montrent l’importance et l’apport de la télédétection appliquée aux données utilisées classiquement en épidémiologie afin de produire des informations d’aide à la compréhension et à la prévention d’épidémies dans le temps et dans l’espace. Ces travaux sont d’une utilité majeure pour les autorités de santé pour mieux comprendre les déterminants de ces maladies et optimiser leurs stratégies de lutte et de surveillance.

Surveillance, prevention and control of infectious and emerging diseases are conducted through various public health actions. To do so, it is necessary to know the spatio-temporal dynamics of these diseases by identifying their environmental, climatic and socio-economic determinants. For this, tools such as tele-epidemiology can contribute to the surveillance and prevention of possible epidemics. Over the last fifteen years, dengue epidemics have increased in number and the chikungunya and Zika viruses have emerged in French Guyana. At the same time, other infectious diseases such as Mayaro virus infection, Q fever and yellow fever continue to be transmitted in French Guiana. The general objective of the thesis was to study the spatial dynamics of these diseases in order to better understand their environmental determinants. A first characterisation of the spatial distribution of the seroprevalence of arboviruses was carried out on the whole territory thanks to a large survey of the general population. This revealed, surprisingly, that the risk of arbovirus transmission was higher in the Maroni region, along the Surinamese border. This area of the territory appears to be a privileged target for prevention and anti-vectorial actions, but also for vaccination campaigns against yellow fever. The various studies conducted have also made it possible to identify the environmental and socio-economic factors that increase the risk of being infected by these diseases. The second part of the work was focused on modelling and mapping the risk of the presence/absence of Ae. aegypti larvae, the main vectors of arboviroses in French Guyana. The remotely sensed environmental variables and meteorological parameters were used to create a database in which six predictors were identified. The integration of these predictors into a statistical model and its extrapolation made it possible to produce predictive maps of the presence/absence of Ae. aegypti larvae in the three communes surrounding Cayenne. The various results obtained show the importance and contribution of remote sensing applied to data classically used in epidemiology in order to produce information to help understand and prevent epidemics in time and space. This work is of major use to health authorities in order to better understand the determinants of these diseases and optimise their control and surveillance strategies.