Études structurales et biochimiques sur les complexes d'élongation de l'ARN polymérase liés aux facteurs de transcription NusG et NusA
Auteur / Autrice : | Chengjin Zhu |
Direction : | Albert Weixlbaumer |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biophysique et biologie structurale |
Date : | Soutenance le 26/02/2021 |
Etablissement(s) : | Strasbourg |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg) |
Jury : | Président / Présidente : Markus Wahl |
Examinateurs / Examinatrices : Elisa Bergamin | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Markus Wahl, Carsten Sachse |
Mots clés
Résumé
L'ARN-polymérase (ARNP) est l'enzyme clé de la transcription. Elle est étroitement régulée par des facteurs au cours du cycle de la transcription. Les deux facteurs NusA et NusG, ont un effet opposé sur la pause transcriptionnelle. Le but de ma thèse est d'utiliser la cryo-EM en analyse de particules isolées combinée à des analyses biochimiques pour mettre en évidence la régulation de l'ARNP par NusA et NusG, et ces deux facteurs ensemble. Nous démontrons que l'ARNP elle-même a un mouvement dynamique constant entre conformation non-pivotante et pivotante. NusA stabilise l'ARNP dans une conformation pivotante qui est proche de l'état de pause, alors que NusG favorise un état non-pivotant de l'ARNP. NusG-CTD est en compétition avec NusA sur un même site de liaison, le module Flap-Tip-Helix de l'ARNP. Les résultats biochimiques ont montré que NusA et NusG, compensent leurs effets et modulent la vitesse de transcription. Cependant, dans le contexte de la terminaison, rho-dépendante, NusA et NusG, ensemble pourraient augmenter l'efficacité de la terminaison précoce.