Thèse soutenue

Développement d’outils analytiques pour l’analyse de biomarqueurs de longue durée de vie de l’ypérite dans les échantillons biologiques

FR  |  
EN
Auteur / Autrice : Florine Hallez
Direction : Valérie Pichon-Comparot
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Chimie
Date : Soutenance le 24/09/2021
Etablissement(s) : Sorbonne université
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Chimie physique et chimie analytique de Paris Centre (Paris ; 2000-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire Sciences Analytiques, Bioanalytiques et Miniaturisation (Paris)
Jury : Président / Présidente : Ludovic Bellot-Gurlet
Examinateurs / Examinatrices : Vincent Delatour
Rapporteurs / Rapporteuses : Carlos Afonso, Marcel van der Schans

Résumé

FR  |  
EN

L’ypérite est un agent vésicant pouvant réagir avec l’hémoglobine pour former des adduits stables utilisés comme biomarqueurs de longue durée de vie et pouvant être détectés jusqu’à 120 jours dans l’organisme. Leur analyse est principalement réalisée par une procédure de séquençage qui cible uniquement les adduits formés avec les valines N-terminales de l’hémoglobine, procédure laborieuse et chronophage pouvant manquer de sensibilité et de répétabilité. De plus, l’alkylation sur les valines N-terminales ne représente que 1 à 2% de l’alkylation totale et l’analyse de digestats tryptiques a démontré que d’autres résidus pouvaient être alkylés. Une nouvelle approche analytique, basée sur le développement d’une étape de digestion de la protéine exposée in vitro à l’ypérite sur un réacteur enzymatique immobilisé (IMER) à base de trypsine, couplé en ligne avec l’analyse des peptides alkylés par LC-MS/MS, a donc été développée pour confirmer une exposition à l’ypérite. Cette méthode a permis d’identifier cinq nouveaux sites d’adduction et s’est avérée répétable et linéaire sur la gamme de concentration étudiée. Après optimisation d’une procédure d’extraction de l’hémoglobine du sang, la méthode a été appliquée à l’analyse d’échantillons dopés à l’ypérite. La durée totale de la procédure est inférieure à 7h contre 2,5 jours pour l’étape de préparation des échantillons seule avec la méthode de séquençage usuelle. Des peptides alkylés résultant de l’exposition du sang à une teneur en ypérite de 14 ng.mL-1 ont pu être détectés, soulignant ainsi la sensibilité de la méthode, et les sites préférentiels d’adduction de l’ypérite sur l’hémoglobine en milieu biologique ont été identifiés.