Thèse soutenue

Interactions entre Aspergillus fumigatus et Stenotrophomonas maltophilia au sein d’un biofilm mixte & modulation de leurs réponses aux antimicrobiens
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Auteur / Autrice : Lolita Roisin
Direction : Françoise Botterel-Chartier
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie cellulaire et moléculaire
Date : Soutenance le 12/02/2021
Etablissement(s) : Paris Est
Ecole(s) doctorale(s) : Ecole doctorale Sciences de la Vie et de la Santé
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Dynamic Microbiology - EA 7380 / DYNAMIC
Jury : Président / Présidente : Virginie Pruliere Escabasse
Examinateurs / Examinatrices : Françoise Botterel-Chartier, Stéphane Ranque, Catherine Neuwirth, Florent Morio, David Lebeaux
Rapporteurs / Rapporteuses : Stéphane Ranque, Catherine Neuwirth

Résumé

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Aspergillus fumigatus (Af, champignon filamenteux) et Stenotrophomonas maltophilia (Sm, bacille à Gram négatif) peuvent coloniser le tractus respiratoire des patients atteints de mucoviscidose. Ces pathogènes peuvent former des biofilms, un mode de vie conférant certains avantages, notamment une diminution de la sensibilité aux traitements. Un modèle in vitro de biofilm mixte développé dans notre laboratoire décrit un antagonisme de Sm sur Af avec un couple de souches cliniques de référence. La première partie de cette thèse a permis d'analyser la formation du biofilm mixte avec des souches de Sm de différentes origines afin de rechercher si cet antagonisme est souche-dépendante. Seules certaines souches cliniques de Sm peuvent induire un antagonisme sur Af après 24 h de co-culture à 37°C. La deuxième partie de cette thèse consistait à évaluer la sensibilité aux antimicrobiens des biofilms simples et mixtes par des méthodes colorimétriques, de culture et par qPCR. Nos résultats montrent que le contact direct de Sm augmente la sensibilité à l'amphotéricine B d'Af. En revanche, Af améliore la tolérance à la lévofloxacine et à la rifampicine de Sm. Cette tolérance semble dépendre de la biomasse fongique elle-même dépendante du degré d’antagonisme généré par la bactérie. Nos essais d’association d'antifongique-antibiotique ont été efficaces contre le biofilm mixte, mettant en lumière l'importance des interactions microbiennes dans la lutte contre les biofilms. Ce travail de thèse vient donc enrichir les données de la littérature sur les interactions et la sensibilité d’un biofilm champignon filamenteux-bactérie, un domaine de recherche qui reste peu étudié.