Etudier l'origine et l'écologie de virus émergents et re-émergents : arbovirus en Afrique
Auteur / Autrice : | Raisa Silva Raulino |
Direction : | Martine Peeters, Ahidjo Ayouba |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biologie Santé |
Date : | Soutenance le 15/12/2021 |
Etablissement(s) : | Montpellier |
Ecole(s) doctorale(s) : | Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : TransVIHMI, UMI 233 IRD (Montpellier) |
Jury : | Examinateurs / Examinatrices : Martine Peeters, Ahidjo Ayouba, Renato S. de Aguiar, Richard Njouom, Vincent Foulongne, Marcelo A. Soares |
Rapporteurs / Rapporteuses : Renato S. de Aguiar, Richard Njouom |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Mots clés libres
Résumé
Les arbovirus sont responsables d'un fardeau de santé publique important dans le monde entier avec plus de 150 espèces virales ayant la capacité de provoquer des maladies chez l'homme. Presque tous sont zoonotiques et circulent entre les hôtes vertébrés et les vecteurs hématophages tels que les moustiques, les tiques et les moucherons. Presque tous sont maintenus dans des cycles de transmission sylvatiques impliquant la faune. Depuis lors, les arbovirus ont provoqué des épidémies dans le monde entier et de nouveaux arbovirus ont émergé de leurs réservoirs sylvatiques tels que les virus West Nile, Usutu et Zika comme exemples les plus récents. Comprendre l'émergence de la maladie arbovirale chez l'homme et développer des méthodes de surveillance pour prédire son apparition dépend de la compréhension de l'écologie des différents arbovirus et de leurs cycles de vie. Pendant les périodes enzootiques, les arbovirus survivent via des cycles de vie sylvatiques qui peuvent impliquer une variété d'espèces dont beaucoup ne sont actuellement pas identifiées, notamment en Afrique. On ne sait pas exactement quelles espèces animales et combien peuvent contribuer au maintien des arbovirus dans la nature, néanmoins les cycles sylvatiques/zoonotiques de nombreux virus transmis par les moustiques sont présentés avec des moustiques arboricoles se nourrissant de primates non humains (PNH). Cependant, cela peut être extrêmement simplifié car le nombre de leurs populations et le nombre d'animaux sensibles à tout moment ne sont pas suffisants pour maintenir les cycles sylvatiques et d'autres mammifères sont probablement également impliqués. Ainsi, l'objectif de ce projet est de fournir de nouvelles informations sur le réservoir animal ou les hôtes amplificateurs, l'écologie des arbovirus dans les pays africains et de documenter l'étendue des taux d'infection chez les animaux. Nous avons développé un outil sérologique qui permet la détection simultanée d'anticorps IgG dirigés contre plusieurs arbovirus dans un seul échantillon biologique. Avec ce dosage immunologique multiplex hautement sensible et spécifique, nous avons criblé plus de 6000 échantillons d'une grande diversité d'espèces de primates et de chauves-souris en Afrique centrale et de l'Ouest. Les primates du Cameroun et de la République démocratique du Congo ont montré une prévalence globale d'IgG inférieure à 5%. Les espèces de chauves-souris en Guinée, au Cameroun et en République démocratique du Congo ont montré une prévalence globale d'IgG de 8,45 %. Tant les échantillons de primates que de chauves-souris ont réagi avec au moins un des dix antigènes testés, des séroprévalences variables ont été observées selon les sites de collecte, le comportement environnemental de l'espèce et pour le virus. Nous concluons que les PNH africains ne sont probablement pas le seul réservoir des arbovirus testés et la présence d'anticorps IgG chez les chauves-souris suggère qu'ils pourraient également jouer un rôle dans le cycle sylvatique des arbovirus en plus des PNH.Mots clés : Arbovirus, Primates, Chauves-souris, Afrique, Anticorps, Luminex