Etude structure/fonction des interactions de C1q avec des récepteurs de type immunoglobuline impliqués dans la tolérance immune et l'auto-immunité

Structure/function studies of C1q interactions with Ig-like receptors : implications in immune tolerance and autoimmunity

• Auteur / Autrice : Guillaume Fouët
• Direction : Véronique Rossi, Christine Gaboriaud
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie structurale et nanobiologie
• Date : Soutenance le 23/02/2021
• Etablissement(s) : Université Grenoble Alpes
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale chimie et science du vivant (Grenoble ; 199.-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de biologie structurale (Grenoble, Isère, France ; 1992-....)
• Jury : Président / Présidente : Franck Fieschi
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Véronique Rossi, Christine Gaboriaud
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Catherine Guedes-Moali, Lubka Roumenina

Mots clés

Mots clés contrôlés

Immunologie expérimentale

Système immunitaire

Autoimmunité

Mots clés libres

Autoimmunité

C1q

Tolerance immune

Récepteurs Ig-Like

Autoimmunity

C1q

Ig-Like receptor

Immune tolerance

Résumé

La molécule C1q a longtemps été étudiée pour son rôle majeur dans l’activation de la voie classique du complément. C1q peut reconnaître de nombreux motifs à la surface des pathogènes ou du soi altéré, via ses six régions globulaires C-terminales (GR). L’autre partie de la protéine, les régions collagéniques (CLR) de C1q, sont généralement associées au tétramère de protéases C1r et C1s (C1r2s2), responsable de l’initiation de la cascade du complément. Ces dernières années, des interactions de C1q avec de nombreux récepteurs membranaires ont été mises en évidence. Parmi ces fonctions indépendantes du complément, un rôle de modulation de la réponse immune par C1q est médié par son interaction avec des récepteurs à domaines de type immunoglobuline (Ig-like) : RAGE (receptor for advanced glycation end-products), CD33, LAIR-1 (leukocyte-associated Ig-like receptor 1) et LAIR-2. Ces récepteurs ont des activités opposées sur les signaux inflammatoires : RAGE induit des signaux pro-inflammatoires alors que CD33 et LAIR-1 sont des récepteurs anti-inflammatoires. Les signaux induits par l’interaction de C1q dépendent donc des récepteurs mis en jeu. Des études récentes suggèrent que RAGE et CD33 interagissent avec les GR alors que LAIR-1 reconnaît les CLR de C1q, ce qui génère un réseau d’interactions complexe qui module la réponse immune en regroupant des signaux pro- et anti-inflammatoires. Cette thèse a pour but d’élucider les détails moléculaires de l’interaction de C1q avec ces récepteurs afin d’aider à la compréhension de la modulation de la réponse immune par C1q. Nous nous sommes principalement intéressés à l’interaction de C1q avec LAIR-1. Une stratégie de dissection moléculaire de C1q, couplée à des expériences de compétition ainsi que l’utilisation de variants de C1q nous ont permis de localiser le site d’interaction de LAIR-1 proche mais différent de celui de C1r2s2 sur les CLR de C1q. Du côté de LAIR-1, une analyse par mutagénèse dirigée nous a permis d’identifier les acides aminés impliqués dans l’interaction avec C1q. Ces résultats suggèrent un modèle d’interaction de C1q avec le domaine Ig-like de LAIR-1. De plus, l’interaction spécifique de LAIR-1 avec les CLR de C1q nous a incité à développer la première production recombinante de cette région de C1q (CLR_nc2). Le remplacement des GR de C1q par le deuxième domaine non collagénique du collagène IX nous a permis de contrôler la mise en registre spécifique des chaînes collagéniques de C1q. La protéine CLR_nc2 a constitué un outil important dans le cadre de cette thèse et le sera certainement également pour l’étude future de l’interaction de C1q avec ses nombreux récepteurs.

C1q has long been studied and described for its central role in the activation of the complement classical pathway. This C1q molecule is able to recognize and interact with a large number of molecular patterns on pathogens or altered-self surfaces through its six C-terminal globular regions (GR). On the other side of the protein, the collagen-like regions (CLR) of C1q are generally associated with the soluble tetramer of C1r and C1s proteases (C1r2s2) that is responsible for the initiation of the complement cascade. Over the last years, several complement-independent functions were shown to be held by C1q through its interaction with various membrane receptors present on cell surfaces. Among these functions, the immune modulation properties of C1q have been recently described and were shown to engage immune receptors from the immunoglobulin-like (Ig-like) family: receptor for advanced glycation end-products (RAGE), CD33, leukocyte-associated Ig-like receptor 1 (LAIR-1) and LAIR-2. These receptors have opposite activities towards inflammation: RAGE triggers pro-inflammatory pathways whereas LAIR-1 and CD33 are immune inhibitory receptors. The C1q-mediated signaling differs whether C1q interacts with one or several of these receptors simultaneously. Recent studies suggest that RAGE and CD33 interact with C1q GR while LAIR-1 binds the C1q CLR, leading to a complex interaction network that congregates pro and anti-inflammatory signals, thus modulating the immune response. This PhD thesis aims at deciphering the fine details of C1q interaction with these receptors in order to provide fundamental insights into the C1q-mediated immune modulation. We mainly focused on the interaction of C1q with the collagen receptor LAIR-1. Thanks to the molecular dissection of C1q associated with competition assays and use of recombinant C1q variants, we showed that LAIR-1 binding site is located in close proximity to but is different from the one of C1r2s2 on C1q CLR. On the LAIR-1 side, we performed a mutational analysis based on literature and structural data to identify the key residues involved in C1q binding. These results led us to propose a model of C1q CLR interaction with the Ig-like domain of LAIR-1. Moreover, the specific recognition of C1q CLR by LAIR-1 led us to develop and generate the first recombinant production of C1q CLR (CLR_nc2). The replacement of the C1q GR by the second non-collagenous domain of collagen IX allowed the preservation of the specific C1q collagen chains registering. The CLR_nc2 was an important tool in the context of this PhD thesis and it will certainly also be useful for the future studies on C1q interaction with its many receptors.