Etude du genre Porphyromonas dans le micro-environnement broncho-pulmonaire des patients atteints de mucoviscidose

Study of the genus Porphyromonas in the lung micro-environment of people with cystic fibrosis

• Auteur / Autrice : Charles-Antoine Guilloux
• Direction : Geneviève Héry-Arnaud
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance le 08/11/2021
• Etablissement(s) : Brest
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé (Nantes)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Génétique, Génomique fonctionnelle et Biotechnologies (Brest ; 2012-....)
• Jury : Président / Présidente : Luc Dubreuil
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Geneviève Héry-Arnaud, Luc Dubreuil, Mustapha Si-Tahar, Katy Jeannot, Isabelle Sermet-Gaudelus, Patricia Lepage, Corentine Alauzet
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Mustapha Si-Tahar, Katy Jeannot

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bactéries anaérobies

Microflore

Mucoviscidose

Mots clés libres

Microbiote pulmonaire

Porphyromonas

Mucoviscidose

Lung microbiota

Porphyromonas

Cystic fibrosis

Résumé

Des études récentes sur le microbiote pulmonaire des patients atteints de mucoviscidose ont mis en lumière une part importante de bactéries anaérobies dont le rôle exact n’est pas connu à ce jour. Parmi ces bactéries, le genre Porphyromonas est associé à un microbiote sain et identifié comme un genre d’intérêt, car potentiellement prédictif de la colonisation à Pseudomonas aeruginosa au niveau pulmonaire chez les patients atteints de mucoviscidose. Toutefois, très peu d’informations sont disponibles sur les espèces non pigmentées de Porphyromonas comme P. catoniae à l’inverse de P. gingivalis. L’objectif de cette thèse était de mieux comprendre le rôle du genre Porphyromonas au sein du microbiote pulmonaire des patients atteints de mucoviscidose.Cette thèse a permis de mettre en évidence que les espèces non pigmentées de Porphyromonas (P. catoniae et P. pasteri) dominaient dans l’environnement pulmonaire et non P. gingivalis. Contrairement à l’espèce P. gingivalis, ces espèces arborent un comportement commensal vis-à-vis de l’hôte voir un comportement potentiellement protecteur lors de l’infection pulmonaire à P. aeruginosa dans un modèle murin de pneumonie aiguë. Bien que d’autres études soient nécessaires pour conclure définitivement, cette thèse met en avant l’importance de distinguer les espèces pigmentées et non pigmentées de Porphyromonas au niveau pulmonaire dont les impacts semblent opposés.

Recent studies on lung microbiota highlight an important part of anaerobic bacteria those role is not yet deciphered. Among those bacteria, the genus Porphyromonas is associated with a healthy microbiota and was identified as a potential predictive biomarker of lung infection to Pseudomonas aeruginosa in people with cystic fibrosis. However, not much informations are available on non-pigmented species of Porphyromonas like P. catoniae, conversely to P. gingivalis. The goal of this thesis was to better understand the role of Porphyromonas within the lung microbiota of people with cystic fibrosis.This thesis highlights that non pigmented species of Porphyromonas (P. catoniae and P. pasteri) dominate in the lung environment and not P. gingivalis. Conversely to the species P. gingivalis, those species seems to act as commensals for the host and are potentially protective in the context of a lung acute infection by P. aeruginosa in a murin model. Despite the need of further studies to conclude, this thesis highlight the importance to distinguish pigmented and non pigmented Porphyromonas species in the lung environment as they seem to act differently.