Influence des communautés environnantes sur le risque de maladie de l'huître creuse dans les écosystèmes marins

Influence of surrounding communities on the Pacific oyster disease risk in marine environments

• Auteur / Autrice : Elyne Dugény
• Direction : Fabrice Pernet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Ecologie marine
• Date : Soutenance le 07/09/2021
• Etablissement(s) : Brest
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la mer et du littoral (Plouzané)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire des sciences de l’environnement marin (Plouzané, Finistère)
• Jury : Président / Présidente : Gwenaelle Le Blay Laliberte
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Fabrice Pernet, Gwenaelle Le Blay Laliberte, Guillaume Mitta, Sophie Gaudriault, Ika Paul-Pont, Ana Lokmer
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Guillaume Mitta, Sophie Gaudriault

Mots clés

Mots clés contrôlés

Algues marines

Relations hôte-parasite

Maladies

Crassostrea gigas

Mots clés libres

Bivalve

Maladie

Interactions biotiques

Holobionte

Microbiome

Pathogènes

Bivalve

Disease ecology

Biotic interactions

Holobionte

Microbiome

Pathogen

Résumé

Les maladies infectieuses structurent les communautés vivantes dans les écosystèmes et dépendent des interactions hôte-pathogène-environnement. Dans cet « interactome », l’effet de facteurs biotiques sur le risque infectieux en milieu marin, a reçu moins d’attention que les facteurs abiotiques. Pourtant, un animal n’est jamais isolé dans son milieu et est en perpétuelle interaction avec d’autres organismes. Lui-même, en tant qu’holobionte, est dépendant de l’équilibre de son microbiome. Ainsi, ce travail de thèse s’est articulé sur l’influence de communautés d’algues environnantes sur le modèle de l’huître creuse et sa sensibilité à une infection virale. Les algues vertes se sont avérées être un facteur aggravant pour la survie de l’huître, tout en causant une déstabilisation de son microbiote. Ces résultats ont été observés avec des algues de différentes origines géographiques et sur deux années. Par cette approche holistique, ces observations ont permis d’amener des perspectives dans le concept de « pathobiome ». Les résultats obtenus apportent des éléments de compréhension des effets biotiques sur les interactions hôte-pathogène et contribuent à une meilleure connaissance de facteurs de risques d’émergence de maladie.

Infectious diseases are structuring living communities in ecosystems and rely on host-pathogen-environment interactions. In this "interactome", the effect of biotic factors on the disease risk in marine environments has received less attention than abiotic factors. However, animals are never isolated in the environment and are in constant interaction with other organisms. As holobionts, they are also dependent on their microbiome equilibrium. In this context, this PhD thesis focused on the influence of surrounding algae communities on the Pacific oyster and its susceptibility to a viral infection. Green algae have been shown to decrease oysters’survival in disease context, while causing a disruptionof the oyster microbiome. These results wereobserved with algae of different geographical originsand over two years. Through this holistic approach,these observations allow to bring perspectives intothe "pathobiome" concept. The results obtained provide elements for understanding the biotic effects on host-pathogeninteractions and contribute to a better understanding of risk factors for disease emergence.