Analyse de l’écologie des jeunes stades de grande alose (Alosa alosa, Clupeidae) : Préférences écologiques, sensibilité aux pressions environnementales et restauration des populations

par Loïc Baumann

Thèse de doctorat en Écologie évolutive, fonctionnelle et des communautés

Sous la direction de Marie-Laure Acolas et de Agnès Bardonnet.

Soutenue le 25-02-2021

à Bordeaux , dans le cadre de École doctorale Sciences et Environnements (Pessac, Gironde) , en partenariat avec Ecosystèmes aquatiques et changements globaux (Bordeaux) (laboratoire) et de FREEMA (équipe de recherche) .


  • Résumé

    La grande alose Alosa alosa est une espèce de poisson migratrice anadrome dont les populations ont fortement décliné au cours des dernières décennies. Les principales causes avancées pour expliquer ce déclin sont la surpêche, la dégradation et la perte d'habitats, les ruptures de connectivité sur les voies de migration et le changement climatique. En particulier, les premiers stades de vie d'A. alosa sont soumis à de nombreuses pressions (recherche de proies, risque de prédation, ruptures de connectivité physiques et chimiques, adaptation physiologique liée à l'osmorégulation...) qui conditionnent le succès de leur phase continentale et de leur migration vers l'aval. Cependant, cette phase critique est très peu documentée. En raison des difficultés liées à l’identification et à la capture de grandes aloses dans le milieu naturel, des expérimentations ex-situ ont été réalisées. Des grandes aloses ont été élevées pendant leurs trois premiers mois de vie dans des conditions semi-naturelles (rivières artificielles) proposant différents habitats. Les préférences d'habitat et le comportement des juvéniles d'alose ont été analysés sur la base d'observations directes et de suivi vidéo. De nouvelles informations ont également pu être acquises sur leur alimentation et leurs mouvements en eau douce. Une autre expérimentation a été réalisée dans l’optique d’évaluer la tolérance de ces organismes aux stress combinés de température et d'hypoxie, en se basant sur des indicateurs comportementaux. Ces travaux apportent de nouvelles connaissances sur l'écologie des jeunes stades de l'espèce et permettent de discuter de son statut, en particulier dans le bassin versant Gironde-Garonne-Dordogne où aucun signe clair de remontée des effectifs n'a été détecté pour la population locale malgré un moratoire sur la pêche adopté en 2008. Ces informations pourront être utilisées pour améliorer les pratiques de gestion et anticiper les tendances des populations de grande alose dans le contexte actuel de changement global.

  • Titre traduit

    Analysis of the ecology of the young stages of allis shad (Alosa alosa, Clupeidae) : ecological preferenda, sensitivity to environmental pressures and population restoration


  • Résumé

    The allis shad Alosa alosa is an anadromous fish species whose populations have shown an important decline throughout the last decades. The main causes put forward to explain this decline are overfishing, habitat degradation and loss, connectivity breaks on migratory paths, and climate change. In particular, the early stages of life of A. alosa are exposed to numerous pressures (search for prey, risk of predation, physical and chemical connectivity breaks, physiological adaptation related to osmoregulation...) which can have an influence on the success of their continental phase and downstream migration. However, this critical phase is very little documented. Given the difficulties to identify and capture allis shad in the wild, ex-situ experiments have been carried out. Young allis shad were reared during their first three months of life in semi-natural conditions (artificial rivers) offering different habitats. The habitat selection and the behaviour of juvenile were analysed basing on direct observations and video monitoring. New information was also acquired on their feeding and their movements in freshwater. Another experiment was carried out in order to assess the tolerance of those organisms to combined stresses of temperature and hypoxia, based on behavioural indicators. This work provides new knowledge on the ecology of the young stages of life of the species and allows discussion on its status, particularly in the Gironde-Garonne-Dordogne watershed where no clear signs of recovery have been detected for the local population despite a fishery moratorium adopted in 2008. This information would be of interest to improve management practices and to anticipate trends in shad populations in the current context of global change.


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